More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5247 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 224 aa  466  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  60.27 
 
 		 234 aa  288  5.0000000000000004e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  52.38 
 
 		 277 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0475  hydrogenase accessory protein HypB  53.08 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  50.46 
 
 		 352 aa  228  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  51.46 
 
 		 246 aa  221  7e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  52.58 
 
 		 407 aa  221  8e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  51.46 
 
 		 247 aa  221  9e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  51.36 
 
 		 254 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  51.46 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  51.17 
 
 		 394 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  50.24 
 
 		 257 aa  218  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  49.76 
 
 		 250 aa  218  5e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  50.24 
 
 		 305 aa  218  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  49.76 
 
 		 300 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  47.42 
 
 		 301 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  48.36 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  49.03 
 
 		 295 aa  215  4e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  49.52 
 
 		 294 aa  215  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  51.9 
 
 		 226 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  49.03 
 
 		 244 aa  214  8e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  49.28 
 
 		 267 aa  214  9e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  46.01 
 
 		 284 aa  213  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  49.28 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  48.18 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  48.18 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.18 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.18 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  48.18 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.18 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.18 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.18 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  48.57 
 
 		 292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.73 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  48.6 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  49.29 
 
 		 278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  48.84 
 
 		 276 aa  211  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.73 
 
 		 290 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.73 
 
 		 290 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.73 
 
 		 290 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.73 
 
 		 290 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  48.1 
 
 		 284 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0427  hydrogenase accessory protein HypB  48.1 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  47.64 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  47.42 
 
 		 217 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  46.61 
 
 		 326 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  47.93 
 
 		 303 aa  209  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0802  hydrogenase accessory protein HypB  46.92 
 
 		 279 aa  209  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.287566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1963  hydrogenase accessory protein HypB  46.72 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2815  hydrogenase-3 accessory protein, assembly of metallocenter  44.26 
 
 		 345 aa  208  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  50.23 
 
 		 279 aa  208  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  46.26 
 
 		 281 aa  208  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  49.03 
 
 		 270 aa  207  7e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1810  hydrogenase accessory protein HypB  45.98 
 
 		 292 aa  207  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.27 
 
 		 290 aa  207  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3881  hydrogenase accessory protein HypB  45.58 
 
 		 267 aa  207  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  47.62 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1285  hydrogenase accessory protein HypB  43.43 
 
 		 345 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.497783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2417  hydrogenase accessory protein HypB  47.64 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0580161  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  46.26 
 
 		 303 aa  206  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  48.36 
 
 		 273 aa  206  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.11 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  45.37 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  48.8 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  48.13 
 
 		 244 aa  205  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  47.89 
 
 		 312 aa  205  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3365  hydrogenase expression/synthesis, HypA  49.76 
 
 		 263 aa  205  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  48.33 
 
 		 283 aa  205  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  48.1 
 
 		 268 aa  205  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  46.95 
 
 		 321 aa  205  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  49.76 
 
 		 322 aa  205  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2445  hydrogenase accessory protein HypB  43.51 
 
 		 323 aa  204  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  44.8 
 
 		 225 aa  205  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  48.06 
 
 		 262 aa  204  6e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  47.89 
 
 		 282 aa  204  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  47.83 
 
 		 296 aa  204  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  44.91 
 
 		 281 aa  204  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  48.33 
 
 		 261 aa  204  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  46.63 
 
 		 224 aa  204  7e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  48.33 
 
 		 261 aa  204  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  48.54 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  47.89 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3219  hydrogenase accessory protein HypB  49.47 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2488  hydrogenase accessory protein HypB  46.22 
 
 		 308 aa  202  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  44.8 
 
 		 307 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  46.38 
 
 		 218 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1648  hydrogenase accessory protein HypB  50.24 
 
 		 223 aa  201  8e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  44.91 
 
 		 280 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.33 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  45.83 
 
 		 268 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  48.1 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  46.38 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.37 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  47.85 
 
 		 289 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1938  hydrogenase accessory protein HypB  44.55 
 
 		 283 aa  199  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2482  hydrogenase accessory protein HypB  45.71 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0298  hydrogenase accessory protein HypB  50.23 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3200  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.82 
 
 		 287 aa  198  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2436  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.89 
 
 		 264 aa  198  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>