More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5201 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2543  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  74.51 
 
 
406 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3563  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  74.51 
 
 
406 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5201  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  100 
 
 
403 aa  845    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86768e-21 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5047  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  64.15 
 
 
400 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4840  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  63.13 
 
 
439 aa  549  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00169429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0782  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  62.82 
 
 
440 aa  541  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00024869  unclonable  0.0000000785266 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3658  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  67.18 
 
 
405 aa  542  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108889  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0978  ferredoxin-NADP oxidoreductase  60.95 
 
 
403 aa  503  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000202848  normal  0.0244193 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0749  ferredoxin--NADP reductase (FNR)  52.64 
 
 
398 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.14944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1917  ferredoxin--NADP reductase (FNR)  57.46 
 
 
396 aa  403  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484005  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09411  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  62.54 
 
 
366 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0946789 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11131  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  58.77 
 
 
361 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.93922 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11821  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  59.32 
 
 
321 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.140856  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1086  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  60.32 
 
 
370 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.569863  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11651  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  62.29 
 
 
384 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11811  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  61 
 
 
326 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0675  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  58.77 
 
 
381 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15081  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  59.47 
 
 
387 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.459762  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23717  predicted protein  47.64 
 
 
340 aa  271  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.239668  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12813  predicted protein  46.82 
 
 
298 aa  268  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42018  predicted protein  46.82 
 
 
320 aa  267  2e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.953925  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28333  predicted protein  44.11 
 
 
360 aa  258  1e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0642636  normal  0.462802 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15777  predicted protein  46.18 
 
 
299 aa  257  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.112856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1323  benzoyl-CoA oxygenase, component A  36.88 
 
 
417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6638  benzoyl-CoA oxygenase, component A  36.39 
 
 
393 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1220  benzoyl-CoA oxygenase subunit A  32.8 
 
 
415 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.655891  normal  0.0139439 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0890  benzoyl-CoA oxygenase, component A  33.92 
 
 
414 aa  186  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0095  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  36.33 
 
 
428 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1538  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  35.42 
 
 
416 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1630  benzoyl-CoA oxygenase, component A  37.93 
 
 
426 aa  173  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170592  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1424  benzoyl-CoA oxygenase, component A  34.03 
 
 
413 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0072  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  33.23 
 
 
439 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2694  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  34.72 
 
 
413 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3661  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  37.55 
 
 
431 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0734  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.1 
 
 
424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197929  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2942  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.55 
 
 
427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.453854  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0222  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  31.06 
 
 
423 aa  155  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  34.51 
 
 
607 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  34.51 
 
 
604 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  34.51 
 
 
604 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  34.07 
 
 
604 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0992  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  32.19 
 
 
245 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0107588 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0631  FAD-binding domain protein  32.61 
 
 
376 aa  102  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.346009 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  33.04 
 
 
623 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  32.9 
 
 
1338 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  31.3 
 
 
613 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.65 
 
 
596 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  31.6 
 
 
1257 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3790  FAD-binding domain-containing protein  36.09 
 
 
388 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.62 
 
 
591 aa  99.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  35.41 
 
 
1341 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  34.76 
 
 
1384 aa  96.7  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  32.61 
 
 
614 aa  96.3  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.64 
 
 
599 aa  96.3  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  32.17 
 
 
631 aa  96.3  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.34 
 
 
599 aa  96.3  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.64 
 
 
599 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  34.93 
 
 
1357 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.64 
 
 
599 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.27 
 
 
594 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3056  FAD-binding domain protein  36.02 
 
 
554 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.38 
 
 
599 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  32.76 
 
 
1409 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.79 
 
 
599 aa  93.2  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1738  FAD-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
659 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4232  sulfite reductase  32.19 
 
 
539 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3748  sulfite reductase  32.91 
 
 
540 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.08 
 
 
594 aa  90.5  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.26 
 
 
598 aa  90.1  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.8 
 
 
607 aa  89.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.85 
 
 
584 aa  89  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.74 
 
 
610 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  32.17 
 
 
1407 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1753  sulfite reductase  31.62 
 
 
539 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274813  normal  0.0164644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  32.14 
 
 
1312 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  31.75 
 
 
1342 aa  87  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  29.91 
 
 
1396 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1693  CpcD phycobilisome linker domain protein  59.15 
 
 
76 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.268965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  30.57 
 
 
1317 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5007  sulfite reductase  33.04 
 
 
535 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125173  normal  0.198772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0157  CpcD phycobilisome linker domain protein  53.16 
 
 
79 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00508163 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  29.11 
 
 
608 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2866  sulfite reductase  32.17 
 
 
537 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890512  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  29.57 
 
 
1418 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  29.57 
 
 
1418 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  29.57 
 
 
1418 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  29.57 
 
 
1398 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  29.13 
 
 
1427 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  29.57 
 
 
1418 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  29.57 
 
 
1418 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  29.57 
 
 
1418 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
883 aa  83.2  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0975  sulfite reductase subunit alpha  29.36 
 
 
600 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.74 
 
 
1383 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4491  sulfite reductase  31.9 
 
 
534 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4954  sulfite reductase  31.9 
 
 
534 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  29.36 
 
 
612 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3442  sulfite reductase subunit alpha  29.36 
 
 
600 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02133  sulfite reductase  27.9 
 
 
615 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.887727  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.57 
 
 
600 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>