More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5164 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  100 
 
 
321 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  73.79 
 
 
291 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  67.93 
 
 
291 aa  407  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  67.93 
 
 
291 aa  407  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  58.16 
 
 
300 aa  352  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.49 
 
 
328 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  31.62 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  29.9 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  29.9 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  33.86 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  30.29 
 
 
332 aa  115  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  30.83 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  29.63 
 
 
327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  29.96 
 
 
305 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  32.3 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.92 
 
 
294 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  30.52 
 
 
314 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  30.52 
 
 
325 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  30.71 
 
 
294 aa  103  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.1 
 
 
320 aa  99.8  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  29.13 
 
 
293 aa  99.4  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
308 aa  99.4  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  26.3 
 
 
339 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  29.77 
 
 
295 aa  98.2  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.92 
 
 
320 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.58 
 
 
320 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.17 
 
 
320 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1613  hypothetical protein  30.08 
 
 
342 aa  93.6  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.899214  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  27.09 
 
 
357 aa  92.8  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.58 
 
 
320 aa  92.8  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 
219 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  28.64 
 
 
221 aa  89.7  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  38.51 
 
 
255 aa  89.4  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  32.16 
 
 
306 aa  89.4  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  27.46 
 
 
343 aa  87.8  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.12 
 
 
320 aa  87  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  29.8 
 
 
381 aa  87.4  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.26 
 
 
324 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  36.54 
 
 
216 aa  85.9  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.93 
 
 
324 aa  85.9  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.45 
 
 
209 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  32.45 
 
 
209 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  28.29 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.95 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.1 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1407  NmrA family protein  27.24 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226857 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  29.44 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.58 
 
 
250 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.49 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  27.38 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  34.76 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  30.67 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  28.94 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
225 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  30.48 
 
 
232 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  28.03 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.38 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  26.02 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.69 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  28.45 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3907  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.21 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  32.89 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  29.87 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2842  hypothetical protein  28.8 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  32.02 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  32.57 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  34.22 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.73 
 
 
320 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.21 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.84 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  31.58 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0479  NmrA family protein  26.32 
 
 
289 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 
301 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  31.42 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  35.16 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  29.26 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3136  NmrA family protein  30.6 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  29.02 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  32.96 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  29.82 
 
 
257 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1059  hypothetical protein  24.92 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000180564  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  29.73 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1587  NmrA family protein  29.17 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428697  normal  0.242272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  30.48 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  28.26 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1791  NmrA family protein  28.31 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3070  hypothetical protein  26.84 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  27.38 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>