137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5059 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5059  AAA ATPase  100 
 
 
518 aa  1067    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.32918 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0145  hypothetical protein  41.57 
 
 
518 aa  340  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0155  AAA ATPase  32.75 
 
 
544 aa  254  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.754147  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2778  hypothetical protein  26.15 
 
 
490 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000124034  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  28.06 
 
 
486 aa  94  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  26.14 
 
 
586 aa  90.5  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0049  prophage Lp2 protein 4  25.85 
 
 
558 aa  71.6  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.19169  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  25.85 
 
 
597 aa  70.5  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2294  hypothetical protein  28.1 
 
 
549 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646796  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  23.97 
 
 
515 aa  63.9  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3089  conjugal transfer ATPase TrbE  23.73 
 
 
812 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  30.71 
 
 
369 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  33.33 
 
 
268 aa  50.4  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  23.19 
 
 
816 aa  50.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  23.19 
 
 
816 aa  50.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2329  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  26.47 
 
 
326 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000238837  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  40.54 
 
 
368 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2804  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  36.21 
 
 
263 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  30.19 
 
 
341 aa  48.5  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
271 aa  48.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  31.67 
 
 
541 aa  47.8  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2168  ABC transporter related  41.67 
 
 
274 aa  47.4  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  36.84 
 
 
249 aa  47  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  33.33 
 
 
276 aa  47  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  25.64 
 
 
418 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  36.73 
 
 
371 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  44.19 
 
 
228 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3530  ABC transporter related  41.67 
 
 
236 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5391  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  42.5 
 
 
290 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  29.58 
 
 
510 aa  46.6  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1406  ABC transporter related  42 
 
 
254 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1494  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  37.5 
 
 
299 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0815348  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  23.47 
 
 
830 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  23.46 
 
 
836 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  38.33 
 
 
239 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0289  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  42.5 
 
 
288 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  34 
 
 
276 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0333  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  42.5 
 
 
306 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  37.04 
 
 
252 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0988  phosphate transporter ATP-binding protein  42.5 
 
 
252 aa  45.1  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.265224  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  30.77 
 
 
262 aa  45.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  39.13 
 
 
260 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  28.17 
 
 
268 aa  45.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0469  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  44.74 
 
 
254 aa  45.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
279 aa  45.1  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1591  ABC transporter related  29.85 
 
 
478 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.243746 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  32 
 
 
443 aa  45.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4298  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  25.76 
 
 
305 aa  45.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  hitchhiker  0.00350718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  22.8 
 
 
847 aa  45.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  38.3 
 
 
245 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2341  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  29.63 
 
 
271 aa  45.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.113454  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  28.57 
 
 
247 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  45.45 
 
 
288 aa  45.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32 
 
 
270 aa  44.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  29.85 
 
 
545 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3367  conjugal transfer ATPase TrbE  22.01 
 
 
814 aa  45.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  43.48 
 
 
266 aa  44.7  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  30.69 
 
 
340 aa  44.7  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1163  ABC transporter related  39.53 
 
 
255 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7425  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.71 
 
 
270 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0646  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
333 aa  44.3  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.473104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3266  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 
259 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3103  phosphate transporter ATP-binding protein  40.48 
 
 
259 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0127377  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1877  phosphate transporter ATP-binding protein  40 
 
 
253 aa  44.3  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 
256 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.9 
 
 
374 aa  44.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  29.87 
 
 
274 aa  44.3  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  41.86 
 
 
1141 aa  44.3  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  39.53 
 
 
503 aa  44.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  41.86 
 
 
516 aa  44.3  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3927  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  28.21 
 
 
381 aa  44.3  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4716  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  30.77 
 
 
271 aa  44.3  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.309342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6687  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  26.03 
 
 
270 aa  44.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523672  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1236  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  29.85 
 
 
286 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.534632  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  34.38 
 
 
243 aa  44.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  38.1 
 
 
377 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5183  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  30.77 
 
 
271 aa  44.3  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  36.96 
 
 
296 aa  44.3  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  32.86 
 
 
252 aa  44.3  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1189  ABC transporter related  40 
 
 
243 aa  44.3  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  31.58 
 
 
315 aa  43.9  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
259 aa  44.3  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4467  ABC transporter related  30.51 
 
 
242 aa  44.3  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  36.96 
 
 
259 aa  44.3  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  22.86 
 
 
812 aa  44.3  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  38 
 
 
275 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.73 
 
 
375 aa  44.3  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5255  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  30.77 
 
 
271 aa  44.3  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.273698  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.34 
 
 
280 aa  44.3  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  31.25 
 
 
257 aa  44.3  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0843  ATPase  22.69 
 
 
602 aa  43.9  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000396112  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3565  phosphate ABC transporter permease  31.82 
 
 
259 aa  43.9  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  30.77 
 
 
419 aa  43.9  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  32.76 
 
 
263 aa  43.9  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3978  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  37.78 
 
 
254 aa  43.9  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1221  decreased coverage  0.00203887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2072  ABC transporter related protein  36.59 
 
 
341 aa  43.9  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0526  ABC transporter related  32.81 
 
 
237 aa  43.9  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  32.76 
 
 
316 aa  43.9  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  37.29 
 
 
274 aa  43.9  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1114  ABC transporter related  32.79 
 
 
453 aa  43.9  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0650865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>