More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5012 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 430 aa  875    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  78.92 
 
 		 429 aa  705    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  78.92 
 
 		 429 aa  704    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  74.7 
 
 		 435 aa  622  1e-177  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  72.45 
 
 		 429 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 445 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 		 436 aa  458  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 430 aa  458  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  53.49 
 
 		 426 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 423 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 		 426 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 		 423 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 429 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 426 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 433 aa  397  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 419 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 426 aa  388  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 422 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 421 aa  385  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 421 aa  385  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  48.92 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  48.21 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 428 aa  378  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 424 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 423 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0653  histidyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.75164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2889  histidyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 422 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 421 aa  371  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 421 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 430 aa  368  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 450 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  49.11 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0683  histidyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 442 aa  364  1e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 425 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 425 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 424 aa  364  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>