More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4802 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  83.14 
 
 
425 aa  733    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  83.14 
 
 
425 aa  733    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  75 
 
 
411 aa  641    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  84.07 
 
 
427 aa  728    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  72.99 
 
 
423 aa  634    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  73.24 
 
 
423 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  74.51 
 
 
429 aa  638    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  75.98 
 
 
431 aa  655    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  79.81 
 
 
427 aa  709    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  78.92 
 
 
427 aa  719    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
427 aa  880    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  75.5 
 
 
411 aa  644    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  75.25 
 
 
424 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1678  serine hydroxymethyltransferase  85.61 
 
 
426 aa  713    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  78.44 
 
 
425 aa  702    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  72.79 
 
 
416 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  72.51 
 
 
423 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  71.78 
 
 
423 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  61.77 
 
 
429 aa  542  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  62.14 
 
 
412 aa  544  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  62.08 
 
 
415 aa  542  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  63.02 
 
 
411 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 
417 aa  536  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  60.53 
 
 
418 aa  535  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 
420 aa  535  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  63.97 
 
 
413 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 
415 aa  532  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  61.02 
 
 
415 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 
437 aa  534  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 
414 aa  528  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 
415 aa  528  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  61.17 
 
 
412 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  61.17 
 
 
412 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 
427 aa  531  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 
415 aa  528  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 
415 aa  528  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 
415 aa  530  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  62.95 
 
 
439 aa  525  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  62.65 
 
 
410 aa  526  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  60.48 
 
 
413 aa  526  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  63.75 
 
 
438 aa  526  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 
432 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  61.41 
 
 
410 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  62.07 
 
 
417 aa  522  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  63.5 
 
 
438 aa  524  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 
413 aa  522  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 
416 aa  522  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 
417 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 
412 aa  523  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  63.9 
 
 
418 aa  521  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  61.95 
 
 
431 aa  524  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  61.96 
 
 
432 aa  524  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  61.17 
 
 
410 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 
417 aa  523  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 
412 aa  520  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  59.18 
 
 
413 aa  518  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 
412 aa  519  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 
417 aa  518  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  60.63 
 
 
434 aa  518  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  62.41 
 
 
432 aa  519  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  60.87 
 
 
434 aa  519  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  61 
 
 
431 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  60.87 
 
 
434 aa  519  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  59.42 
 
 
413 aa  519  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 
419 aa  521  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  59.18 
 
 
413 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 
417 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
417 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 
414 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  58.51 
 
 
423 aa  515  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  59.18 
 
 
414 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 
422 aa  517  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  61.3 
 
 
431 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 
424 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 
417 aa  514  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  61.95 
 
 
417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 
415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
417 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  61.3 
 
 
415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  60.82 
 
 
415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 
415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  61.37 
 
 
417 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  60.82 
 
 
415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  62.38 
 
 
508 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  61.3 
 
 
415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 
417 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  63.25 
 
 
411 aa  516  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.666958 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  60.82 
 
 
415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  61.3 
 
 
415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 
417 aa  511  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  60.91 
 
 
431 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  61.73 
 
 
417 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  60.63 
 
 
434 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 
413 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  58.7 
 
 
413 aa  513  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 
414 aa  514  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  61.43 
 
 
415 aa  511  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>