More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4798 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4798  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
227 aa  467  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1037  cyclic nucleotide-binding protein  55.95 
 
 
227 aa  265  5e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2804  cyclic nucleotide-binding protein  57.85 
 
 
229 aa  258  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3296  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  57.85 
 
 
229 aa  258  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.721133  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  50.22 
 
 
227 aa  248  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  48.46 
 
 
227 aa  244  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  41.82 
 
 
237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
232 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  40.72 
 
 
232 aa  153  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
234 aa  145  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.96 
 
 
235 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1533  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.68 
 
 
231 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.93 
 
 
235 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.93 
 
 
235 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28321  putative regulatory protein  33.16 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.270503 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.02 
 
 
225 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
231 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.44 
 
 
225 aa  89  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.79 
 
 
236 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.98 
 
 
225 aa  88.2  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  25.23 
 
 
225 aa  88.2  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.56 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.11 
 
 
226 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.5 
 
 
223 aa  85.5  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1243  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.16 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00145976  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.9 
 
 
224 aa  82  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 
225 aa  82  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  26.61 
 
 
225 aa  82  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.23 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  25.11 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.19 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  25.96 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.37 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.77 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  27.7 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.47 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.44 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  25.23 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  29 
 
 
226 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.63 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.91 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  23.87 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.44 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6804  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.78 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  25.58 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.03 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.72 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0120826  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.26 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.79 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  24.09 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  25 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.09 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2417  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
250 aa  72  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.034588  normal  0.0382931 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.88 
 
 
226 aa  72  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
224 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  27.53 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.8 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.28 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.74 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  23.74 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.74 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.74 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0098  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.74 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.4392599999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.64 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.25 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.52 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  27.61 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.32 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.12 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1234  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.53 
 
 
251 aa  68.2  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  29.8 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1697  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.87 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  hitchhiker  0.0000199045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0750  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6844  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.16 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0901192  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  27.36 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.12 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.34 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2812  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.54 
 
 
243 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  23.74 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  24.24 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.12 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.57 
 
 
231 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3198  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.88 
 
 
221 aa  67  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.90573 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.94 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5739  cyclic nucleotide-binding protein  26.61 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.172184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.37 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.88 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.46 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.63 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.94 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>