More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4740 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  69.72 
 
 
437 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
449 aa  922    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  86 
 
 
447 aa  795    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  68.58 
 
 
437 aa  656    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  81.04 
 
 
447 aa  771    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  67.82 
 
 
436 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  71.03 
 
 
439 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  69.66 
 
 
439 aa  654    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  69.43 
 
 
439 aa  654    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  67.82 
 
 
436 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  81.32 
 
 
444 aa  750    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  68.58 
 
 
437 aa  656    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  68.28 
 
 
436 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  85.43 
 
 
447 aa  795    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  67.82 
 
 
436 aa  639    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  81.04 
 
 
444 aa  773    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  78.62 
 
 
437 aa  736    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2532  adenylosuccinate synthetase  78.83 
 
 
445 aa  714    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  55.92 
 
 
427 aa  513  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  56.71 
 
 
427 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  56.47 
 
 
428 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  58.06 
 
 
427 aa  501  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  53.4 
 
 
427 aa  487  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  56.18 
 
 
430 aa  483  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  54.63 
 
 
427 aa  476  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  52.25 
 
 
424 aa  476  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 
429 aa  471  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  54.85 
 
 
426 aa  474  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  52.24 
 
 
426 aa  471  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 
430 aa  472  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 
430 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  53.92 
 
 
427 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  52.68 
 
 
433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  52.73 
 
 
428 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 
428 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  52.94 
 
 
427 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  54.61 
 
 
427 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23100  Adenylosuccinate synthase  53.5 
 
 
428 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  52.72 
 
 
428 aa  465  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  51.75 
 
 
429 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1280  adenylosuccinate synthetase  55.19 
 
 
427 aa  468  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  49.18 
 
 
429 aa  463  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  53.08 
 
 
428 aa  464  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  52.68 
 
 
430 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  51.65 
 
 
427 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
424 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  52.68 
 
 
431 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  52.46 
 
 
427 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  53.44 
 
 
427 aa  458  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  51.16 
 
 
433 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 
434 aa  456  1e-127  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  51.78 
 
 
426 aa  455  1e-127  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
431 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  51.27 
 
 
438 aa  457  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  51.28 
 
 
430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  50.58 
 
 
428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  50.58 
 
 
428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  52.58 
 
 
432 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 
427 aa  450  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0504  adenylosuccinate synthetase  52.35 
 
 
431 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 
432 aa  451  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  52.35 
 
 
431 aa  448  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1958  adenylosuccinate synthetase  52.13 
 
 
425 aa  449  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0069  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 
432 aa  451  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215485  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0515  adenylosuccinate synthetase  52.35 
 
 
431 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 
426 aa  448  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0526  adenylosuccinate synthetase  52.35 
 
 
431 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  52.11 
 
 
431 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  51.54 
 
 
428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 
429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 
429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  50.84 
 
 
428 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 
432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 
429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  53.92 
 
 
427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  51.9 
 
 
433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 
429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  50.58 
 
 
432 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  50.58 
 
 
432 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  50.58 
 
 
432 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5137  adenylosuccinate synthetase  54.69 
 
 
433 aa  444  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  48.47 
 
 
430 aa  443  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  51.18 
 
 
439 aa  443  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 
429 aa  441  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
429 aa  440  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 
430 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 
451 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  50.95 
 
 
428 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  47.29 
 
 
427 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 
428 aa  435  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  49.4 
 
 
434 aa  437  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  48.6 
 
 
431 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  51.96 
 
 
438 aa  436  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0492  adenylosuccinate synthetase  50.84 
 
 
428 aa  436  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  50.7 
 
 
430 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 
429 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>