More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4602 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.21 
 
 
974 aa  709    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 
977 aa  679    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  41.68 
 
 
952 aa  707    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 
1012 aa  665    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
974 aa  1981    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 
1065 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
1155 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.05 
 
 
2325 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
1098 aa  406  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
1127 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
1098 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
1078 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
1736 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
1137 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
1616 aa  391  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
1125 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
989 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
989 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.18 
 
 
1180 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
928 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.25 
 
 
1197 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
941 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  35.24 
 
 
1020 aa  320  7.999999999999999e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  32.34 
 
 
2301 aa  302  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
2423 aa  300  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  32.86 
 
 
783 aa  297  5e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  33.4 
 
 
785 aa  296  1e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.58 
 
 
1866 aa  296  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  31.71 
 
 
770 aa  295  4e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
808 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  30.8 
 
 
2476 aa  291  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  32.52 
 
 
769 aa  291  5.0000000000000004e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.12 
 
 
1971 aa  291  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  33.27 
 
 
770 aa  291  6e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  30.8 
 
 
2458 aa  290  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  33.94 
 
 
774 aa  290  1e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
2539 aa  289  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  32.11 
 
 
769 aa  289  2e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
1758 aa  289  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  32.11 
 
 
769 aa  289  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
1974 aa  287  8e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
1646 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
911 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
1646 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  31.15 
 
 
1987 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.94 
 
 
2336 aa  286  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
1647 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
2212 aa  283  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  32.62 
 
 
2284 aa  283  2e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  31.49 
 
 
803 aa  282  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.78 
 
 
1992 aa  282  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
2414 aa  281  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
1629 aa  280  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.08 
 
 
1960 aa  280  7e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
1609 aa  280  7e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
740 aa  280  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  31 
 
 
2092 aa  279  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
896 aa  277  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
896 aa  277  9e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 
762 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 
1907 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.8 
 
 
1956 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  28.73 
 
 
1834 aa  276  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
756 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.15 
 
 
764 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
911 aa  275  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
2012 aa  273  9e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  29.64 
 
 
2048 aa  273  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
784 aa  273  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  33.4 
 
 
793 aa  273  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
755 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
2009 aa  272  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
1832 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
765 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  29.78 
 
 
864 aa  271  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  29.78 
 
 
864 aa  271  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
767 aa  271  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  29.78 
 
 
864 aa  270  7e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  29.78 
 
 
864 aa  270  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  29.78 
 
 
864 aa  270  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  29.78 
 
 
864 aa  270  7e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 
2026 aa  270  8e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  28.5 
 
 
2026 aa  270  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  29.59 
 
 
832 aa  270  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  32.48 
 
 
764 aa  270  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  30.8 
 
 
1970 aa  269  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  29.78 
 
 
1079 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  32.09 
 
 
769 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.87 
 
 
789 aa  267  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  28.98 
 
 
1989 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
760 aa  265  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  29 
 
 
1643 aa  264  6e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
1725 aa  264  6.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
934 aa  263  8e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
742 aa  263  8.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  28.98 
 
 
1983 aa  263  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  32 
 
 
741 aa  263  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 
1725 aa  261  5.0000000000000005e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
705 aa  260  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  27.49 
 
 
2301 aa  258  6e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>