More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4601 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  100 
 
 		 473 aa  947    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  50 
 
 		 495 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  49.78 
 
 		 495 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  45.86 
 
 		 495 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  42.63 
 
 		 492 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  42.89 
 
 		 478 aa  362  6e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  42.69 
 
 		 551 aa  362  9e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  49.15 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  36.48 
 
 		 387 aa  137  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  27.66 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  35.02 
 
 		 365 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  27.17 
 
 		 920 aa  127  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  24.88 
 
 		 508 aa  126  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  28.03 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  28.72 
 
 		 922 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  30.08 
 
 		 931 aa  117  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  29.05 
 
 		 828 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  29.05 
 
 		 828 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  25.8 
 
 		 580 aa  114  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  26.9 
 
 		 915 aa  114  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  27.51 
 
 		 910 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  25.16 
 
 		 897 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  26.86 
 
 		 919 aa  110  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  27.1 
 
 		 919 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  29.12 
 
 		 948 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 		 921 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  29.05 
 
 		 936 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  26.13 
 
 		 833 aa  106  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  27.14 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  27.49 
 
 		 869 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.18 
 
 		 920 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  27.51 
 
 		 834 aa  101  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  27.8 
 
 		 827 aa  101  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  28.72 
 
 		 828 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  23.87 
 
 		 912 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  26.62 
 
 		 264 aa  99  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  28.72 
 
 		 837 aa  99  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  28.72 
 
 		 837 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  28.72 
 
 		 837 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  25.8 
 
 		 869 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  23.59 
 
 		 1055 aa  97.8  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  26.61 
 
 		 781 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  26.56 
 
 		 952 aa  94.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  27.45 
 
 		 977 aa  93.6  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  25.88 
 
 		 347 aa  93.2  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16271  hypothetical protein  25.42 
 
 		 577 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  29.7 
 
 		 446 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  25.82 
 
 		 947 aa  92.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  23.53 
 
 		 803 aa  91.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  27.21 
 
 		 270 aa  91.3  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17951  hypothetical protein  22.25 
 
 		 417 aa  91.3  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  26.21 
 
 		 830 aa  90.5  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  27.3 
 
 		 379 aa  90.5  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  25.63 
 
 		 940 aa  90.1  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  26.14 
 
 		 869 aa  90.1  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0827  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 456 aa  90.5  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.895511  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  31.79 
 
 		 200 aa  89.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  27.05 
 
 		 833 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  27.37 
 
 		 387 aa  89.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  24.57 
 
 		 753 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  27.03 
 
 		 388 aa  89.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  29.52 
 
 		 277 aa  89  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 264 aa  87.8  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  27.92 
 
 		 351 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  23.63 
 
 		 576 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  25.08 
 
 		 298 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  31.32 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  23.82 
 
 		 823 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  30.54 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1375  polysaccharide export-related periplasmic protein  22.95 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00608351  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.8 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  25.35 
 
 		 852 aa  83.6  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.39 
 
 		 396 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.8 
 
 		 391 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  28.39 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  28.99 
 
 		 392 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.8 
 
 		 391 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  26.69 
 
 		 431 aa  83.2  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.88 
 
 		 378 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  28.09 
 
 		 407 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  24.19 
 
 		 812 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  26.18 
 
 		 846 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  34.29 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  27.27 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  27.78 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  33.81 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  28.43 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  29.27 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  28.66 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  27.36 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  26.58 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  30.36 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  27.73 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  25.81 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0660  polysaccharide export protein  23.43 
 
 		 823 aa  80.9  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  27.73 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  27.73 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  23.86 
 
 		 830 aa  80.5  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  26.55 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  27.73 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>