287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4561 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  49.65 
 
 		 1003 aa  859    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  50.35 
 
 		 1007 aa  909    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  56.59 
 
 		 1008 aa  1021    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  52.04 
 
 		 1008 aa  966    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  56.69 
 
 		 1008 aa  1023    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  100 
 
 		 1007 aa  2016    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  48.63 
 
 		 1016 aa  904    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  30.89 
 
 		 1023 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  30.42 
 
 		 1022 aa  409  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  30.13 
 
 		 1022 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  29.39 
 
 		 1031 aa  383  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  30.09 
 
 		 1019 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  30.81 
 
 		 859 aa  347  8.999999999999999e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  30.45 
 
 		 859 aa  202  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  30.33 
 
 		 859 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  26.79 
 
 		 857 aa  173  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  22.1 
 
 		 993 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  21.72 
 
 		 994 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  23.35 
 
 		 906 aa  113  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  25.88 
 
 		 891 aa  112  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2563  exonuclease SbcC  31.8 
 
 		 1000 aa  108  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.679449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  21.96 
 
 		 1009 aa  104  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  21.33 
 
 		 864 aa  103  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  33.17 
 
 		 895 aa  95.1  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  21.33 
 
 		 858 aa  94.4  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  22.76 
 
 		 993 aa  94  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  31.98 
 
 		 924 aa  92  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  33.33 
 
 		 902 aa  92  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  28.87 
 
 		 978 aa  89.7  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  28.24 
 
 		 891 aa  89  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  29.3 
 
 		 890 aa  88.2  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  22.52 
 
 		 1033 aa  86.3  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  23.7 
 
 		 961 aa  85.1  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  21.23 
 
 		 993 aa  84.7  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  20.07 
 
 		 1057 aa  84.7  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  31.68 
 
 		 851 aa  82.4  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  27.84 
 
 		 910 aa  82  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  29.94 
 
 		 904 aa  78.6  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  26.53 
 
 		 1019 aa  75.5  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  26.46 
 
 		 824 aa  75.5  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  25.36 
 
 		 1030 aa  74.7  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  27.84 
 
 		 1011 aa  73.9  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  29.94 
 
 		 852 aa  73.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  27.66 
 
 		 789 aa  73.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  29.94 
 
 		 852 aa  73.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0037  RecF/RecN/SMC domain-containing protein  19.47 
 
 		 638 aa  72.4  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000359393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  32.4 
 
 		 1116 aa  72  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  28.51 
 
 		 618 aa  72  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  28.5 
 
 		 888 aa  71.6  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  25.16 
 
 		 1029 aa  70.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  24.66 
 
 		 810 aa  69.3  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  25.9 
 
 		 1029 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  25.41 
 
 		 693 aa  68.2  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  26.26 
 
 		 1029 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  24.83 
 
 		 1189 aa  67  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  26.26 
 
 		 1029 aa  66.6  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  25.9 
 
 		 1029 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  25.54 
 
 		 1029 aa  67  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  23.41 
 
 		 702 aa  66.6  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  29.89 
 
 		 1172 aa  66.6  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  29.89 
 
 		 1172 aa  66.6  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  32.26 
 
 		 1018 aa  66.6  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  25.68 
 
 		 1029 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  25.39 
 
 		 1029 aa  66.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  32.26 
 
 		 1018 aa  66.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  32.26 
 
 		 1018 aa  66.2  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  26.15 
 
 		 1165 aa  66.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  32.26 
 
 		 1018 aa  66.2  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  32.26 
 
 		 1018 aa  66.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  21.93 
 
 		 1021 aa  65.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  24.51 
 
 		 1029 aa  65.5  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  23.48 
 
 		 995 aa  65.1  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  22.16 
 
 		 926 aa  65.1  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  32.79 
 
 		 1018 aa  64.7  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  25.9 
 
 		 1029 aa  64.7  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  25.9 
 
 		 1029 aa  64.7  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  32.79 
 
 		 1018 aa  64.3  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  27.08 
 
 		 1180 aa  64.3  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  31.97 
 
 		 1020 aa  63.9  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  25 
 
 		 1226 aa  63.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 824 aa  63.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  27.67 
 
 		 1042 aa  62.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  26.07 
 
 		 1227 aa  63.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  31.15 
 
 		 1018 aa  62.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  24.09 
 
 		 922 aa  62.4  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  29.08 
 
 		 1022 aa  62.4  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  30.65 
 
 		 1018 aa  62.4  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  26.32 
 
 		 815 aa  62.4  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  27.46 
 
 		 1046 aa  62  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  31.4 
 
 		 1018 aa  62  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  26.38 
 
 		 1061 aa  62  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  24.25 
 
 		 1346 aa  62  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  30.58 
 
 		 1018 aa  62  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  30.16 
 
 		 1013 aa  61.6  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  26.08 
 
 		 1177 aa  61.6  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  23.23 
 
 		 1091 aa  61.6  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  27.09 
 
 		 1024 aa  61.6  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  32.63 
 
 		 1234 aa  61.6  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  28.03 
 
 		 1091 aa  61.6  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  28.06 
 
 		 1165 aa  61.2  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>