More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4526 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4526  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
362 aa  728    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.51706 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3601  pentapeptide repeat protein  44.08 
 
 
371 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2505  pentapeptide repeat protein  43.8 
 
 
371 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  43.75 
 
 
256 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  37.94 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 
194 aa  94  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  45.79 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  48.08 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  36.9 
 
 
416 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  48.62 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  47.41 
 
 
517 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  41.91 
 
 
294 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  46.9 
 
 
489 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 
263 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  44.64 
 
 
1033 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  46.72 
 
 
184 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  43.07 
 
 
441 aa  73.9  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  52.63 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  42.42 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  47.96 
 
 
567 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  47.47 
 
 
260 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 
521 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  38.46 
 
 
309 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  40.83 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  42.03 
 
 
182 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  41.35 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  47.46 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  48.45 
 
 
973 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  42.73 
 
 
900 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  41.73 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  41.73 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  34.97 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  46.73 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  44.12 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  43.52 
 
 
418 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  38.98 
 
 
540 aa  69.7  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  45.37 
 
 
449 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  49 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  41.12 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  50.62 
 
 
182 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  41.12 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  46.46 
 
 
576 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  39.6 
 
 
250 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  36.05 
 
 
295 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  44.74 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  42.73 
 
 
168 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  45.79 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  31.18 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  39.42 
 
 
446 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  45.95 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  45.95 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  43.09 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  43.09 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  47.47 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  38.3 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  35.71 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27891  hypothetical protein  46.88 
 
 
288 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  46.74 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  37.8 
 
 
745 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  34.48 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  38.26 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  44.35 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  44.07 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  41.18 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  43.75 
 
 
215 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  40.78 
 
 
381 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  39.47 
 
 
447 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  43 
 
 
493 aa  65.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  40.95 
 
 
734 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  38.81 
 
 
294 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  39.5 
 
 
356 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  40.46 
 
 
315 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  42.71 
 
 
710 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  34.56 
 
 
440 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  39.64 
 
 
234 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  41.89 
 
 
219 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1383  pentapeptide repeat protein  40.82 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.100104  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  36.97 
 
 
450 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  43.52 
 
 
179 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  38.51 
 
 
215 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  38.32 
 
 
727 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  34.03 
 
 
515 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2937  hypothetical protein  36.75 
 
 
393 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.807989  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  45 
 
 
351 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  36.55 
 
 
278 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  44.74 
 
 
336 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  41.28 
 
 
1831 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  44.74 
 
 
336 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  41 
 
 
866 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4134  pentapeptide repeat protein  46.94 
 
 
137 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159468  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  49.41 
 
 
526 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  38.62 
 
 
174 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  37.84 
 
 
217 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  39.83 
 
 
206 aa  63.5  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  39.42 
 
 
537 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  39.83 
 
 
206 aa  63.5  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
268 aa  63.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  44.23 
 
 
165 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>