More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4520 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  100 
 
 		 199 aa  413  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  79.9 
 
 		 200 aa  346  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  79.9 
 
 		 200 aa  346  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  74.35 
 
 		 229 aa  309  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  66.33 
 
 		 201 aa  295  3e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1098  Superoxide dismutase  69.35 
 
 		 200 aa  295  4e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00115059  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0967  superoxide dismutase  66.67 
 
 		 198 aa  290  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  66.83 
 
 		 200 aa  289  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  68.88 
 
 		 197 aa  289  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1539  Superoxide dismutase  65.33 
 
 		 200 aa  278  5e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  64.5 
 
 		 201 aa  275  4e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0983  superoxide dismutase  62.81 
 
 		 200 aa  271  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474017  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  63.64 
 
 		 199 aa  267  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0963  manganese and iron superoxide dismutase  61.5 
 
 		 200 aa  267  8e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  59.3 
 
 		 227 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0378  Superoxide dismutase  61.73 
 
 		 198 aa  260  1e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000638563  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4281  superoxide dismutase  59.09 
 
 		 199 aa  256  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  61.78 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_002978  WD0738  superoxide dismutase, Fe  59.61 
 
 		 206 aa  254  7e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  62.12 
 
 		 193 aa  254  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  61.62 
 
 		 193 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  61.26 
 
 		 209 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  61.11 
 
 		 193 aa  250  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  60.73 
 
 		 209 aa  250  1e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  60.1 
 
 		 192 aa  250  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1462  Superoxide dismutase  60.8 
 
 		 201 aa  249  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0915  superoxide dismutase  61.42 
 
 		 198 aa  248  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0954  superoxide dismutase  61.42 
 
 		 198 aa  248  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.80559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2463  Superoxide dismutase  59.09 
 
 		 193 aa  248  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4486  superoxide dismutase  60.91 
 
 		 198 aa  248  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  60.1 
 
 		 193 aa  247  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0981  superoxide dismutase  60.91 
 
 		 198 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581007  hitchhiker  0.000228043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4473  superoxide dismutase  60.91 
 
 		 198 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0822  superoxide dismutase  57.79 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.600443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  59.6 
 
 		 193 aa  245  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  60.1 
 
 		 233 aa  245  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  60.1 
 
 		 233 aa  245  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3417  manganese and iron superoxide dismutase  57.07 
 
 		 241 aa  243  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0123938 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1986  Superoxide dismutase  57.29 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  59.09 
 
 		 193 aa  240  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0913  manganese and iron superoxide dismutase  54.5 
 
 		 201 aa  240  7.999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  59.6 
 
 		 193 aa  240  9e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2458  superoxide dismutase, Fe  57.58 
 
 		 194 aa  240  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.688146  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1385  superoxide dismutase  58.59 
 
 		 192 aa  239  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0947  Superoxide dismutase  57.95 
 
 		 193 aa  240  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.0414637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0187  superoxide dismutase  54.82 
 
 		 204 aa  239  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6857  Superoxide dismutase  53.54 
 
 		 197 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0552512 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0298  superoxide dismutase  57.36 
 
 		 193 aa  237  9e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.775999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2428  superoxide dismutase  56.57 
 
 		 193 aa  237  9e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.785927  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1895  superoxide dismutase (Fe)  57.36 
 
 		 193 aa  237  9e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0966  Superoxide dismutase  55 
 
 		 200 aa  236  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5903  manganese and iron superoxide dismutase  54.77 
 
 		 199 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.416043  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3621  Superoxide dismutase  53.77 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3319  superoxide dismutase  54.27 
 
 		 198 aa  235  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0845  Superoxide dismutase  55 
 
 		 200 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5305  superoxide dismutase  54.77 
 
 		 199 aa  235  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  55.05 
 
 		 221 aa  235  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0501  superoxide dismutase  58.03 
 
 		 205 aa  235  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  56.35 
 
 		 192 aa  234  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  56.35 
 
 		 192 aa  234  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  55.05 
 
 		 221 aa  234  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3298  superoxide dismutase  53.27 
 
 		 199 aa  234  8e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  55.05 
 
 		 192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  55.05 
 
 		 192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  55.05 
 
 		 192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  55.05 
 
 		 192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0753  superoxide dismutase  56.57 
 
 		 192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174612  normal  0.215519 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3498  Superoxide dismutase  53.27 
 
 		 199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.220165  normal  0.735889 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  55.05 
 
 		 192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1890  Superoxide dismutase  54.73 
 
 		 198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2481  superoxide dismutase  54.55 
 
 		 193 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152277  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  54.55 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1677  superoxide dismutase  54 
 
 		 199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0587  superoxide dismutase  54 
 
 		 200 aa  230  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2023  superoxide dismutase  55.56 
 
 		 192 aa  230  8.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4497  superoxide dismutase  53.27 
 
 		 199 aa  230  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2701  superoxide dismutase  53.5 
 
 		 198 aa  230  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0895268  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1927  superoxide dismutase  54.55 
 
 		 193 aa  229  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3621  superoxide dismutase  52.5 
 
 		 198 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.695841  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3432  superoxide dismutase  54.5 
 
 		 199 aa  229  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2461  superoxide dismutase  55.05 
 
 		 192 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0540  superoxide dismutase  54.04 
 
 		 192 aa  228  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.950904 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2591  superoxide dismutase  55.05 
 
 		 192 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2448  superoxide dismutase  56.78 
 
 		 193 aa  228  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0103073  normal  0.0475458 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  53.47 
 
 		 204 aa  228  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0769  superoxide dismutase  54.04 
 
 		 192 aa  228  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2067  superoxide dismutase, Fe  54.4 
 
 		 210 aa  227  7e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.854961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1335  superoxide dismutase, iron/manganese cofactor  53 
 
 		 199 aa  227  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  53.03 
 
 		 193 aa  227  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  53.03 
 
 		 193 aa  226  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  53.03 
 
 		 193 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  53.03 
 
 		 193 aa  226  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  53.03 
 
 		 193 aa  226  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  53.03 
 
 		 193 aa  226  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  53.03 
 
 		 193 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  53.03 
 
 		 193 aa  226  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000511005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  53.03 
 
 		 193 aa  226  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  53.03 
 
 		 193 aa  226  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1632  superoxide dismutase, Fe  56 
 
 		 194 aa  226  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000440787  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  53.03 
 
 		 193 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>