More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4481 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3545  Sodium/hydrogen exchanger  63.35 
 
 
681 aa  790    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
679 aa  1357    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  66.67 
 
 
689 aa  835    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  36.85 
 
 
719 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 
688 aa  392  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  34.65 
 
 
721 aa  392  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  41.14 
 
 
709 aa  389  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  36.24 
 
 
715 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  36.22 
 
 
751 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  38.03 
 
 
732 aa  350  3e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  37.92 
 
 
716 aa  348  2e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  35.54 
 
 
712 aa  341  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  34.41 
 
 
692 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  34.72 
 
 
716 aa  339  9.999999999999999e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  37.06 
 
 
727 aa  333  6e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  33.86 
 
 
698 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0038  sodium/hydrogen exchanger  36.61 
 
 
692 aa  325  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3051  sodium/hydrogen exchanger  35.61 
 
 
686 aa  322  9.999999999999999e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  33.23 
 
 
698 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2201  sodium/hydrogen exchanger  37.66 
 
 
708 aa  310  8e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3830  sodium/hydrogen exchanger  35.87 
 
 
706 aa  296  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417332  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  30.45 
 
 
722 aa  287  5.999999999999999e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1642  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  29.12 
 
 
699 aa  228  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1401  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  30.98 
 
 
699 aa  220  5e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.972731  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0307  Na+/H+ antiporter  36.25 
 
 
408 aa  194  6e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.74 
 
 
386 aa  114  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  25.94 
 
 
395 aa  109  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  26.45 
 
 
530 aa  107  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  27.25 
 
 
614 aa  105  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  29.22 
 
 
387 aa  105  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  29.04 
 
 
387 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  29.04 
 
 
387 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 
614 aa  103  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 
614 aa  103  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  29.03 
 
 
387 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  29.03 
 
 
387 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  28.76 
 
 
387 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  29.03 
 
 
387 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  26.15 
 
 
611 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  28.57 
 
 
385 aa  102  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  28.76 
 
 
387 aa  102  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  32.32 
 
 
387 aa  101  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  28.76 
 
 
387 aa  101  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  22.68 
 
 
756 aa  100  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  27.01 
 
 
723 aa  100  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  22.76 
 
 
375 aa  100  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  26 
 
 
609 aa  100  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  26 
 
 
609 aa  99  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  26 
 
 
609 aa  99  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  26 
 
 
609 aa  99  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  26 
 
 
609 aa  99  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  26 
 
 
609 aa  99  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  26 
 
 
609 aa  99  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  26.25 
 
 
609 aa  99  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  25.31 
 
 
609 aa  95.9  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  26 
 
 
609 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  26.72 
 
 
379 aa  95.5  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  25.37 
 
 
715 aa  94  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  23.04 
 
 
715 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  23.04 
 
 
715 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 
389 aa  92  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  29.35 
 
 
385 aa  91.3  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  24.68 
 
 
747 aa  91.3  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  26.26 
 
 
399 aa  89.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  24.75 
 
 
416 aa  89.4  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  25.93 
 
 
674 aa  89  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  27.11 
 
 
398 aa  89  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  31.2 
 
 
375 aa  88.6  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  26.5 
 
 
609 aa  87.8  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  29.39 
 
 
375 aa  87.8  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  28.2 
 
 
658 aa  87  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  31.2 
 
 
375 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  26.69 
 
 
636 aa  85.5  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  25.14 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  30.19 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  30.19 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  30.19 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  30.19 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  30.19 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.18 
 
 
608 aa  83.2  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  28.76 
 
 
672 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  26.9 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  26.34 
 
 
665 aa  81.3  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1608  sodium/hydrogen exchanger  30.07 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0247605  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  22.92 
 
 
775 aa  80.5  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  28.23 
 
 
662 aa  80.1  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25 
 
 
399 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  26.88 
 
 
666 aa  78.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  26.77 
 
 
423 aa  78.6  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.08 
 
 
697 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1020  sodium/hydrogen exchanger  28.76 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.259417  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  28.76 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.96 
 
 
567 aa  77.8  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  25.32 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  27.66 
 
 
567 aa  77.4  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  26.13 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  22.98 
 
 
609 aa  76.6  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.49 
 
 
579 aa  77  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  27.12 
 
 
445 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  25.69 
 
 
656 aa  77  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>