60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4390 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 260 aa  500  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  66.28 
 
 		 261 aa  344  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  65.9 
 
 		 261 aa  343  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  60 
 
 		 266 aa  277  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  58.58 
 
 		 270 aa  275  5e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  58.11 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  60.45 
 
 		 270 aa  261  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  52.34 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  32.03 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  35.06 
 
 		 235 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 235 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  31.75 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  31.35 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  29.3 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  27.95 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  32.55 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  28.57 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  28.57 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  29.88 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  34.73 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  29.48 
 
 		 244 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  26.89 
 
 		 287 aa  89  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  30.53 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  28.29 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  30.23 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  28.79 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  29.08 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.6 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  28 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  27.72 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  29.88 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  30.04 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  32.66 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  26.64 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  30.29 
 
 		 770 aa  76.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  30.58 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  29.64 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  27.52 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  27.14 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.32 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  25.84 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  28.35 
 
 		 767 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  25.13 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  33.15 
 
 		 891 aa  63.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  27.31 
 
 		 972 aa  63.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  26.58 
 
 		 748 aa  62.4  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  28.8 
 
 		 977 aa  62  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  26.32 
 
 		 240 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  26.46 
 
 		 964 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  25.87 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  26.36 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 768 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  27.2 
 
 		 736 aa  55.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  27.6 
 
 		 998 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  23.16 
 
 		 368 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  31.75 
 
 		 1106 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>