47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4281 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4281  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  584  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2623  peptidase M56 BlaR1  58.54 
 
 
284 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0123908  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3493  peptidase M56 BlaR1  58.54 
 
 
284 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3768  hypothetical protein  50 
 
 
279 aa  238  8e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0499  hypothetical protein  50.7 
 
 
282 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2565  hypothetical protein  43.55 
 
 
281 aa  226  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.768992  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0183  hypothetical protein  48.18 
 
 
281 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1645  peptidase M56 BlaR1  23.39 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1646  hypothetical protein  23.08 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000626927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1827  hypothetical protein  23.08 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1777  hypothetical protein  23.08 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1595  cell surface protein  23.08 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1625  cell surface protein  22.67 
 
 
270 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000608951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1850  hypothetical protein  24.55 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  28.36 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3553  hypothetical protein  23.89 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.444632  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1791  hypothetical protein  23.89 
 
 
270 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0254  peptidase M48, Ste24p  38.89 
 
 
407 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1903  hypothetical protein  24.55 
 
 
270 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000423406  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  24 
 
 
316 aa  52.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  36.67 
 
 
314 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  30.77 
 
 
315 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  32.11 
 
 
313 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  28.31 
 
 
431 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  36.46 
 
 
314 aa  50.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  33.96 
 
 
328 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2522  peptidase M56, BlaR1  22.32 
 
 
326 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1994  peptidase M48 Ste24p  41.54 
 
 
405 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.235795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  23.21 
 
 
314 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0291  hypothetical protein  29.57 
 
 
328 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.497447  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1350  peptidase M56, BlaR1  27.78 
 
 
260 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.205977  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0824  peptidase M48, Ste24p  32.97 
 
 
301 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0768  peptidase M48 Ste24p  31.87 
 
 
301 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0413822  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  29.14 
 
 
301 aa  46.2  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31050  hypothetical protein  27.87 
 
 
332 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019921  unclonable  2.92536e-22 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  35.42 
 
 
330 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  30.39 
 
 
541 aa  46.2  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  31.4 
 
 
304 aa  46.2  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2482  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 
317 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
334 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  26.47 
 
 
316 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  27.78 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  26.47 
 
 
316 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  26.47 
 
 
316 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  31.63 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1947  peptidase M48 Ste24p  24.54 
 
 
370 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4097  peptidase M56 BlaR1  22.82 
 
 
324 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>