More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4262 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
415 aa  867    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  65.2 
 
 
418 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  65.2 
 
 
418 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  63.25 
 
 
431 aa  556  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  60.57 
 
 
434 aa  545  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  61.45 
 
 
421 aa  526  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  50.61 
 
 
443 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  48.71 
 
 
431 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  48.66 
 
 
446 aa  403  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  41.88 
 
 
415 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  39.57 
 
 
377 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  38.58 
 
 
375 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  38.48 
 
 
365 aa  242  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  37.8 
 
 
361 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  38.57 
 
 
358 aa  219  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.77 
 
 
357 aa  215  9.999999999999999e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  38.59 
 
 
358 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  32.48 
 
 
395 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  32.72 
 
 
373 aa  189  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  34 
 
 
671 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  33.5 
 
 
652 aa  179  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  34.14 
 
 
313 aa  179  8e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  32.92 
 
 
389 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  32.52 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  34.83 
 
 
325 aa  167  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  34.07 
 
 
355 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  32.32 
 
 
390 aa  163  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.92 
 
 
387 aa  160  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  31.22 
 
 
388 aa  159  8e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  30.85 
 
 
385 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  31.82 
 
 
342 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  30.45 
 
 
381 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  30.11 
 
 
356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  30.87 
 
 
468 aa  156  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  30.58 
 
 
657 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  31.48 
 
 
362 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  30.26 
 
 
438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  31.02 
 
 
689 aa  153  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  29.68 
 
 
412 aa  152  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  30.41 
 
 
446 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  31.69 
 
 
424 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  28.68 
 
 
362 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  32 
 
 
686 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  30.94 
 
 
488 aa  150  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  31.67 
 
 
440 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  31.67 
 
 
440 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  32.63 
 
 
361 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  31.09 
 
 
360 aa  150  5e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  32.67 
 
 
698 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  30.81 
 
 
328 aa  149  8e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  31.62 
 
 
319 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  32.19 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.29 
 
 
405 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  29.33 
 
 
374 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  30.62 
 
 
340 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  29.13 
 
 
464 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  30.6 
 
 
398 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  29 
 
 
450 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  32.97 
 
 
309 aa  144  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  31.11 
 
 
313 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  28.8 
 
 
438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  28.5 
 
 
400 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  27.95 
 
 
415 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  28.24 
 
 
370 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  31.19 
 
 
337 aa  140  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  31.81 
 
 
365 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.39 
 
 
362 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  31.34 
 
 
308 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  28.17 
 
 
361 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  40.76 
 
 
334 aa  135  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  30.87 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  30.91 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
423 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  28.79 
 
 
423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  32.58 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  39.88 
 
 
335 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  29.08 
 
 
468 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  27.99 
 
 
310 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  28.02 
 
 
662 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  38.14 
 
 
283 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  27.05 
 
 
465 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  31.51 
 
 
318 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2652  DNA-cytosine methyltransferase  30.31 
 
 
435 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0989832  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  25.49 
 
 
402 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  30.48 
 
 
399 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  29.53 
 
 
423 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  33.46 
 
 
508 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  29.85 
 
 
474 aa  123  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  31.83 
 
 
358 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  25.91 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  27.05 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1487  DNA-cytosine methyltransferase  30.84 
 
 
434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  25.75 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  30.25 
 
 
320 aa  121  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  28.99 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  27.29 
 
 
420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  26.3 
 
 
406 aa  119  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  29.78 
 
 
342 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  25.87 
 
 
454 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>