184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4136 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 
1219 aa  2497    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  44.64 
 
 
1779 aa  768    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  48.65 
 
 
1711 aa  834    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 
1448 aa  666    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  44.69 
 
 
1247 aa  816    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  39.37 
 
 
1621 aa  731    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  42.3 
 
 
994 aa  624  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  57.29 
 
 
1544 aa  569  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  56.62 
 
 
1083 aa  522  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  63.95 
 
 
552 aa  519  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  53.68 
 
 
1321 aa  515  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  30.89 
 
 
992 aa  400  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  43.7 
 
 
393 aa  302  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  44.64 
 
 
724 aa  287  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 
1911 aa  246  1.9999999999999999e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  47.04 
 
 
596 aa  228  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  43.16 
 
 
599 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  36.9 
 
 
1141 aa  218  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  25.22 
 
 
1266 aa  217  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  32.88 
 
 
934 aa  210  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  31.3 
 
 
982 aa  196  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  55.44 
 
 
422 aa  195  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  27.1 
 
 
1007 aa  180  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 
1276 aa  174  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  31.73 
 
 
565 aa  138  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  34.89 
 
 
720 aa  138  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  34.43 
 
 
737 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  26.19 
 
 
962 aa  126  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  37.5 
 
 
476 aa  125  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 
1502 aa  125  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 
916 aa  122  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  33.14 
 
 
720 aa  118  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 
1276 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  32.86 
 
 
371 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  29.11 
 
 
1507 aa  115  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 
1192 aa  113  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  25.28 
 
 
1328 aa  112  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  28.66 
 
 
827 aa  111  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  25.49 
 
 
1051 aa  109  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  32.24 
 
 
714 aa  108  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  34.04 
 
 
560 aa  109  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
632 aa  108  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  36 
 
 
1869 aa  108  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  26.52 
 
 
985 aa  106  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.52 
 
 
2741 aa  107  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  22.38 
 
 
1058 aa  105  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.56 
 
 
2741 aa  104  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.92 
 
 
810 aa  104  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  29.69 
 
 
490 aa  104  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.48 
 
 
1694 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  26.14 
 
 
717 aa  102  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  28.45 
 
 
1288 aa  101  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  25.33 
 
 
919 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 
1162 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 
878 aa  99.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.04 
 
 
1162 aa  98.2  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  26.65 
 
 
1363 aa  97.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0606  hypothetical protein  32.04 
 
 
199 aa  96.3  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.85 
 
 
991 aa  95.1  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.04 
 
 
1215 aa  95.5  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  23.64 
 
 
1060 aa  93.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  30.97 
 
 
322 aa  89.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  30.97 
 
 
322 aa  89.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26 
 
 
649 aa  87.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  21.75 
 
 
854 aa  86.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  32.55 
 
 
326 aa  87  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
454 aa  86.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  34.66 
 
 
341 aa  86.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  36 
 
 
843 aa  85.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.83 
 
 
644 aa  84.7  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  34.48 
 
 
327 aa  82.4  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  38.4 
 
 
326 aa  82  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  38.4 
 
 
326 aa  82  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  36.16 
 
 
325 aa  80.1  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  23.41 
 
 
828 aa  80.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  26.89 
 
 
460 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.31 
 
 
1186 aa  79.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  28.23 
 
 
1009 aa  79  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.71 
 
 
1238 aa  78.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  29.9 
 
 
725 aa  77  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  36.49 
 
 
337 aa  76.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 
868 aa  75.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  29.61 
 
 
1044 aa  75.5  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  28.21 
 
 
493 aa  74.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 
729 aa  74.3  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  31.85 
 
 
445 aa  73.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.98 
 
 
1056 aa  72.4  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  25.36 
 
 
1228 aa  70.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  30.58 
 
 
325 aa  70.1  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 
846 aa  70.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  27.64 
 
 
1131 aa  69.7  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  32.43 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  24.78 
 
 
521 aa  69.3  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 
1450 aa  67.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  26.69 
 
 
1104 aa  67.4  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  22.62 
 
 
884 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  25.63 
 
 
1476 aa  66.2  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  32.17 
 
 
416 aa  66.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  27.2 
 
 
809 aa  65.1  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  28.31 
 
 
425 aa  65.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>