More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4100 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
477 aa  974    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  53.8 
 
 
472 aa  501  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  47.03 
 
 
480 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1872  histidine kinase  43.41 
 
 
482 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1580  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
478 aa  226  8e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  39.49 
 
 
473 aa  193  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
457 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
451 aa  186  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  34.8 
 
 
451 aa  186  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
475 aa  186  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
459 aa  180  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  31.38 
 
 
463 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  31.38 
 
 
463 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  33.63 
 
 
456 aa  179  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  37.84 
 
 
477 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 
470 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  34.55 
 
 
461 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  33.53 
 
 
463 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
504 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  33.94 
 
 
463 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
490 aa  177  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  34.24 
 
 
463 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  33.64 
 
 
463 aa  176  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  30.87 
 
 
463 aa  176  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
584 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  38.43 
 
 
364 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  35.28 
 
 
490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  30.94 
 
 
455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  30.94 
 
 
455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  33.94 
 
 
462 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  38.43 
 
 
364 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  39.01 
 
 
469 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 
584 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
491 aa  173  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255402  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  37.04 
 
 
486 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
455 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
504 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
513 aa  171  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
462 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
438 aa  170  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 
458 aa  170  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
607 aa  170  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 
600 aa  170  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  39.6 
 
 
477 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 
621 aa  169  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  31.15 
 
 
477 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
452 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 
592 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  33.44 
 
 
497 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
371 aa  166  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
364 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 
423 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 
571 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  42.73 
 
 
537 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
546 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  32.46 
 
 
423 aa  163  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
524 aa  163  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
639 aa  163  6e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 
581 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
359 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
639 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
457 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  33.15 
 
 
506 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  35.56 
 
 
397 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
418 aa  161  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
524 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
469 aa  161  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20811  Signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
496 aa  161  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.861206 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 
464 aa  160  4e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
594 aa  160  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
608 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  36.67 
 
 
469 aa  160  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
469 aa  159  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  37.34 
 
 
465 aa  159  7e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 
460 aa  159  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
379 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
379 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
358 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 
609 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
464 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  38.1 
 
 
565 aa  157  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
493 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  33.12 
 
 
360 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 
489 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
611 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
639 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
584 aa  157  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  38.77 
 
 
613 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 
815 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  40.34 
 
 
346 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
623 aa  157  5.0000000000000005e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  29.23 
 
 
484 aa  156  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
477 aa  156  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  29.23 
 
 
484 aa  156  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
379 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  36.03 
 
 
352 aa  156  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
599 aa  156  9e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>