145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4086 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4086  permease  100 
 
 
325 aa  634    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  57.32 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  56.71 
 
 
328 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  41.74 
 
 
343 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  41.74 
 
 
343 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  42.82 
 
 
335 aa  241  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  40.4 
 
 
350 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  39.7 
 
 
350 aa  234  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  44.91 
 
 
336 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  39.71 
 
 
341 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  41.76 
 
 
362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  31.19 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  35.39 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  30.07 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  30.07 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  30.07 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  30.07 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  30.07 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  30.07 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  30.07 
 
 
298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  30.07 
 
 
298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  30.74 
 
 
298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  30.07 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  31.09 
 
 
346 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  29.15 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  30.74 
 
 
300 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  31.7 
 
 
288 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  27.48 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  28.12 
 
 
297 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  35.03 
 
 
318 aa  122  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  28.15 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  28.91 
 
 
288 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  34.87 
 
 
323 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  27.81 
 
 
325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  26.73 
 
 
312 aa  119  9e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  25.74 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  28.22 
 
 
524 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  26.09 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  26.42 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  26.09 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  26.42 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  27.92 
 
 
524 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  28.62 
 
 
358 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  26.07 
 
 
342 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  26.6 
 
 
370 aa  93.2  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  26.46 
 
 
364 aa  86.3  6e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  40.4 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  24.91 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  25.76 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  25.7 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  25.71 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  23.86 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  28.37 
 
 
300 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  24.69 
 
 
357 aa  57.4  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  23.2 
 
 
311 aa  56.2  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  28.67 
 
 
293 aa  56.2  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  23.24 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  23.7 
 
 
368 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  24.46 
 
 
302 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  23.24 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  21.47 
 
 
356 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  29.71 
 
 
318 aa  53.5  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  24.04 
 
 
324 aa  53.1  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  21.95 
 
 
315 aa  52.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0299  permease  21.83 
 
 
286 aa  52.8  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  21.33 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  31.58 
 
 
357 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  23.55 
 
 
333 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  30.36 
 
 
344 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  26.03 
 
 
315 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  26.86 
 
 
353 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  36.26 
 
 
620 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  30.1 
 
 
353 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  32.69 
 
 
354 aa  50.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  24.22 
 
 
365 aa  50.1  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  25.36 
 
 
331 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  23.04 
 
 
368 aa  49.7  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  26.73 
 
 
342 aa  49.7  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  23.02 
 
 
330 aa  49.7  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  32.98 
 
 
633 aa  49.7  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  32 
 
 
350 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  24.88 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  24.88 
 
 
331 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  24.44 
 
 
335 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  25 
 
 
363 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  26.15 
 
 
350 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  25.52 
 
 
315 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  24.88 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  28.57 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  29.08 
 
 
317 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  24.88 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  21.96 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  22.64 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  31.07 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  26.36 
 
 
294 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  23.23 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  30.23 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  20.62 
 
 
323 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0147  putative permease  30.49 
 
 
359 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  29.63 
 
 
351 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>