More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4019 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  100 
 
 
400 aa  820    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  75.25 
 
 
403 aa  636    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  79.24 
 
 
394 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  79.49 
 
 
394 aa  646    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  75 
 
 
402 aa  633  1e-180  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  76.53 
 
 
391 aa  627  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  74.09 
 
 
392 aa  615  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  47.42 
 
 
389 aa  411  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  47.63 
 
 
382 aa  396  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  46.34 
 
 
392 aa  391  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.45 
 
 
390 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  46.84 
 
 
385 aa  387  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  46.46 
 
 
388 aa  386  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  46.56 
 
 
382 aa  381  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  46.42 
 
 
382 aa  379  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  46.84 
 
 
390 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  44.79 
 
 
384 aa  374  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  45.93 
 
 
389 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  44.19 
 
 
391 aa  372  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  45.77 
 
 
382 aa  373  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.91 
 
 
387 aa  370  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  47.49 
 
 
392 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.41 
 
 
388 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.24 
 
 
388 aa  365  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  44.09 
 
 
388 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  44.24 
 
 
401 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  44.47 
 
 
391 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  44.21 
 
 
389 aa  362  9e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  43.27 
 
 
388 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  44.62 
 
 
390 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  43.92 
 
 
390 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  43.41 
 
 
388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  45.14 
 
 
393 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  44.88 
 
 
394 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  45.26 
 
 
409 aa  355  8.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  43.16 
 
 
386 aa  353  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  42.3 
 
 
385 aa  354  2e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  45.26 
 
 
399 aa  352  5e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  44.09 
 
 
394 aa  352  5e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  43.78 
 
 
397 aa  352  7e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  43.19 
 
 
395 aa  352  8e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  43.9 
 
 
403 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0168  aminotransferase class I and II  42.2 
 
 
403 aa  350  2e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.391722  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  43.99 
 
 
405 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  44.39 
 
 
400 aa  350  3e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  42.82 
 
 
402 aa  349  6e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1252  aminotransferase  43.57 
 
 
396 aa  348  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164192  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0567  aminotransferase class I and II  42.93 
 
 
403 aa  348  1e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  42.08 
 
 
411 aa  347  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  43.23 
 
 
397 aa  347  3e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23430  Aminotransferase, class I and II  41.69 
 
 
414 aa  347  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  42.04 
 
 
402 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  41.82 
 
 
412 aa  346  4e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  41.93 
 
 
402 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  43.57 
 
 
421 aa  346  4e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  41.82 
 
 
412 aa  346  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  41.82 
 
 
412 aa  346  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  41.82 
 
 
412 aa  346  5e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  42.19 
 
 
402 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  41.82 
 
 
412 aa  346  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  41.82 
 
 
412 aa  346  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  41.82 
 
 
412 aa  346  5e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  41.82 
 
 
412 aa  346  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  41.82 
 
 
412 aa  346  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  41.82 
 
 
412 aa  346  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  41.82 
 
 
412 aa  346  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  42.97 
 
 
397 aa  345  6e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  43.08 
 
 
411 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  43.48 
 
 
418 aa  345  8e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  41.82 
 
 
412 aa  345  8e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0082  aminotransferase  43.12 
 
 
428 aa  345  8.999999999999999e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0510162 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  42.08 
 
 
411 aa  344  1e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  41.82 
 
 
412 aa  344  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  44.96 
 
 
393 aa  345  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  41.93 
 
 
402 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  41.82 
 
 
412 aa  345  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  44.96 
 
 
393 aa  345  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  42.08 
 
 
411 aa  344  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  42.08 
 
 
411 aa  344  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  43.49 
 
 
384 aa  344  1e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0598  aminotransferase  45 
 
 
394 aa  343  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  41.67 
 
 
402 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  41.78 
 
 
402 aa  343  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  42.82 
 
 
411 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  42.04 
 
 
411 aa  342  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2583  aminotransferase  41.56 
 
 
409 aa  341  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117889  normal  0.0369649 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  42.56 
 
 
407 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  41.56 
 
 
411 aa  338  8e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1203  aspartate aminotransferase  41.65 
 
 
403 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0124735  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  43.04 
 
 
391 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  43.68 
 
 
392 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  43.42 
 
 
403 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  42.52 
 
 
406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  42.52 
 
 
406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  41.99 
 
 
393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  43.34 
 
 
390 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  41.25 
 
 
413 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1027  aspartate aminotransferase  40.62 
 
 
400 aa  336  5e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000262896  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  43.42 
 
 
413 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  41.25 
 
 
413 aa  335  7e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>