25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4014 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4014  Ycf66 family protein  100 
 
 
319 aa  636    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3467  Ycf66 family protein  55.86 
 
 
299 aa  241  9e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2650  Ycf66 family protein  55.56 
 
 
299 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.093415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0519  Ycf66-like  50.9 
 
 
301 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0370943  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0055  Ycf66 family protein  47.93 
 
 
306 aa  203  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1483  Ycf66 family protein  61.44 
 
 
279 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2015  hypothetical protein  49.02 
 
 
277 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.355614 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3709  hypothetical protein  41.67 
 
 
295 aa  176  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0065  hypothetical protein  42.29 
 
 
308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00751  hypothetical protein  71.96 
 
 
309 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00741  hypothetical protein  72.64 
 
 
309 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00721  hypothetical protein  73.27 
 
 
308 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1426  hypothetical protein  76.04 
 
 
320 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00711  hypothetical protein  77.08 
 
 
328 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.721442 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01271  hypothetical protein  76.04 
 
 
320 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.029164  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0418  hypothetical protein  69.52 
 
 
340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2262  hypothetical protein  75 
 
 
310 aa  162  9e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.473761  normal  0.637972 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03191  hypothetical protein  69.79 
 
 
326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.997762 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9568  predicted protein  51.76 
 
 
91 aa  88.2  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3901  hypothetical protein  27.37 
 
 
382 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2673  Ycf66 family protein  33.33 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4866  Ycf66 family protein  29.87 
 
 
365 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0481  Ycf66 family protein  24.04 
 
 
443 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3431  Ycf66 family protein  33.33 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2526  hypothetical protein  22.22 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.766942 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>