24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4004 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4004  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
246 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0417617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2813  beta-lactamase-like protein  68.52 
 
 
226 aa  315  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3287  hypothetical protein  68.52 
 
 
226 aa  315  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0422328  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3439  Beta-lactamase-like  62.15 
 
 
228 aa  276  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254177  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3896  beta-lactamase-like  59.9 
 
 
207 aa  256  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.560821  normal  0.310182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5132  beta-lactamase domain protein  58.02 
 
 
227 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1706  beta-lactamase domain-containing protein  55.51 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.702666  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0088  hypothetical protein  51.34 
 
 
240 aa  238  5e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.45541  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2093  hypothetical protein  37.38 
 
 
219 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.990572  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0578  hypothetical protein  38.05 
 
 
219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.976371  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05701  hypothetical protein  36.08 
 
 
218 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.843109 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13751  hypothetical protein  32.29 
 
 
200 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14831  Zn-dependent hydrolase  28.25 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.861965  normal  0.085675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3174  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 
290 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2624  beta-lactamase domain protein  26.17 
 
 
290 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4330  beta-lactamase domain-containing protein  22.29 
 
 
293 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2101  beta-lactamase domain protein  25.65 
 
 
289 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2145  beta-lactamase domain protein  25.65 
 
 
289 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.518031  normal  0.715051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0646  Beta-lactamase-like  23.43 
 
 
298 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4155  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4601  hypothetical protein  22.73 
 
 
289 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711496  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  30.93 
 
 
348 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45054  predicted protein  23.49 
 
 
429 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.597228  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  37.29 
 
 
214 aa  42  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>