More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3994 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  100 
 
 
734 aa  1488    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  41.9 
 
 
710 aa  535  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  40.65 
 
 
727 aa  519  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  39.62 
 
 
706 aa  503  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  38.85 
 
 
449 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  37.55 
 
 
521 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  35.74 
 
 
381 aa  125  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  37.37 
 
 
576 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  36.64 
 
 
267 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  35.61 
 
 
286 aa  118  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  34.2 
 
 
441 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  33.86 
 
 
320 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  38.46 
 
 
333 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  43.58 
 
 
225 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  37.13 
 
 
309 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  36.9 
 
 
489 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  31.87 
 
 
493 aa  114  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  35.6 
 
 
386 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  38.16 
 
 
567 aa  112  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  38.68 
 
 
264 aa  112  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  44.19 
 
 
340 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  35.38 
 
 
311 aa  110  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  32.79 
 
 
448 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  43.46 
 
 
213 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 
262 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  34.54 
 
 
319 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  40.24 
 
 
903 aa  108  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  35.97 
 
 
262 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  43.09 
 
 
214 aa  107  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  34.47 
 
 
295 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  43.17 
 
 
216 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  38.68 
 
 
517 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  31.82 
 
 
343 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  31.82 
 
 
343 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  35.25 
 
 
332 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  35.05 
 
 
416 aa  105  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  32.86 
 
 
312 aa  104  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  35.63 
 
 
483 aa  104  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  35.34 
 
 
336 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  35.34 
 
 
336 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
291 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  42.7 
 
 
227 aa  101  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  36.05 
 
 
266 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  38.04 
 
 
433 aa  101  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  30.96 
 
 
600 aa  101  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  42.37 
 
 
241 aa  101  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  37.21 
 
 
351 aa  101  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  37.1 
 
 
268 aa  100  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  36.84 
 
 
291 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
294 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  45.34 
 
 
234 aa  99  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  37.43 
 
 
1033 aa  98.6  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  37.88 
 
 
356 aa  97.8  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  32.26 
 
 
250 aa  96.7  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  35.47 
 
 
285 aa  97.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  37.37 
 
 
356 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  38.1 
 
 
219 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  37.8 
 
 
1191 aa  96.3  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  37.65 
 
 
184 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  37.44 
 
 
745 aa  95.1  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  40.91 
 
 
182 aa  94.7  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  36.81 
 
 
189 aa  94.7  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  31.65 
 
 
389 aa  94.7  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  30.57 
 
 
862 aa  94.7  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  33.62 
 
 
452 aa  94  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  34.04 
 
 
412 aa  94  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  37.78 
 
 
401 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  37.78 
 
 
401 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  27.22 
 
 
870 aa  92.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  30.7 
 
 
263 aa  92.8  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  34.05 
 
 
440 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  32.81 
 
 
401 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  35 
 
 
420 aa  92.8  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  39.51 
 
 
199 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  28.52 
 
 
348 aa  92.8  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2409  pentapeptide repeat-containing protein  30.36 
 
 
885 aa  93.2  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  39.13 
 
 
199 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  33.6 
 
 
401 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  37.16 
 
 
278 aa  92  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  31.3 
 
 
418 aa  92  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  37.77 
 
 
225 aa  92  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  36.92 
 
 
384 aa  91.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  32.75 
 
 
259 aa  91.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  30.8 
 
 
485 aa  91.3  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  39.42 
 
 
234 aa  91.3  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  39.42 
 
 
234 aa  91.3  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.63 
 
 
525 aa  91.3  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  33.67 
 
 
412 aa  90.9  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  40.34 
 
 
213 aa  90.9  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  36.69 
 
 
254 aa  90.1  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  31.89 
 
 
210 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 
872 aa  90.1  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  38.27 
 
 
204 aa  90.5  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  31.06 
 
 
949 aa  90.1  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  33.04 
 
 
456 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  34.29 
 
 
237 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  40.28 
 
 
245 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  41.04 
 
 
309 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  37.87 
 
 
277 aa  89.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  32.73 
 
 
273 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>