More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3801 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
295 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  75.43 
 
 
293 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  75.77 
 
 
293 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.86 
 
 
296 aa  435  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.35 
 
 
294 aa  417  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  66.21 
 
 
297 aa  415  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5042  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.97 
 
 
302 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.36 
 
 
295 aa  340  2e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.95 
 
 
295 aa  335  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.54 
 
 
294 aa  335  5.999999999999999e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1197  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.62 
 
 
295 aa  333  2e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.075446  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19771  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.11 
 
 
301 aa  316  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2274  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.56 
 
 
288 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0863  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.9 
 
 
295 aa  311  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17161  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.48 
 
 
295 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14961  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.49 
 
 
295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14821  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.15 
 
 
295 aa  301  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1393  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.15 
 
 
295 aa  301  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4892  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.94 
 
 
280 aa  295  8e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32358  predicted protein  49.68 
 
 
355 aa  292  5e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14581  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.81 
 
 
295 aa  291  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3804  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.89 
 
 
291 aa  278  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.743841  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.31 
 
 
273 aa  223  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.04 
 
 
271 aa  223  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.66 
 
 
265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.19 
 
 
270 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.15 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.35 
 
 
266 aa  216  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.74 
 
 
259 aa  215  9e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.76 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.39 
 
 
269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  45.86 
 
 
259 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.67 
 
 
273 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.74 
 
 
266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.15 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44 
 
 
268 aa  211  7.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.28 
 
 
264 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.15 
 
 
264 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.32 
 
 
264 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.92 
 
 
285 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.85 
 
 
268 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.08 
 
 
266 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.06 
 
 
267 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.32 
 
 
265 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.49 
 
 
268 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.15 
 
 
263 aa  208  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.15 
 
 
263 aa  208  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.53 
 
 
263 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.89 
 
 
270 aa  207  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.16 
 
 
266 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.24 
 
 
285 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.4 
 
 
268 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.53 
 
 
262 aa  206  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.63 
 
 
275 aa  206  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.24 
 
 
285 aa  206  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.77 
 
 
265 aa  205  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.77 
 
 
264 aa  205  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.28 
 
 
272 aa  204  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.87 
 
 
285 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.71 
 
 
265 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.22 
 
 
267 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.02 
 
 
268 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1648  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.7 
 
 
281 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.02 
 
 
271 aa  203  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.87 
 
 
266 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.65 
 
 
295 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
276 aa  202  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.32 
 
 
265 aa  202  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.28 
 
 
267 aa  202  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.64 
 
 
269 aa  202  7e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.73 
 
 
272 aa  202  8e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.56 
 
 
266 aa  201  8e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.61 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.12 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.56 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.1 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.18 
 
 
278 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.35 
 
 
260 aa  200  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.36 
 
 
266 aa  199  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.12 
 
 
267 aa  198  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.44 
 
 
266 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.05 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
259 aa  197  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.39 
 
 
266 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.92 
 
 
271 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0909  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.32 
 
 
271 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000352387  hitchhiker  0.00000000301828 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.36 
 
 
263 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.89 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.99 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2562  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.14 
 
 
279 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.68 
 
 
266 aa  196  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.42 
 
 
277 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.05 
 
 
270 aa  195  9e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.83 
 
 
269 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
259 aa  194  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.12 
 
 
266 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0972  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.79 
 
 
295 aa  193  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0625628  hitchhiker  0.000581353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4483  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
272 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249423  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.59 
 
 
267 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>