54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3781 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  100 
 
 
172 aa  339  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1649  membrane protein of uknown function UCP014873  81.6 
 
 
166 aa  253  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.983052  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1622  membrane protein of uknown function UCP014873  81.6 
 
 
166 aa  253  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  54.04 
 
 
177 aa  180  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  54.04 
 
 
177 aa  180  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1506  membrane protein of uknown function UCP014873  59.35 
 
 
164 aa  173  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  48.81 
 
 
176 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1043  membrane protein of uknown function UCP014873  57.14 
 
 
187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0884518 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  48.81 
 
 
176 aa  161  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3618  hypothetical protein  55.56 
 
 
172 aa  159  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0504408  normal  0.0132377 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1291  hypothetical protein  52.47 
 
 
169 aa  157  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1389  hypothetical protein  50.6 
 
 
175 aa  154  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00355367  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  47.27 
 
 
301 aa  152  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0096  hypothetical protein  57.05 
 
 
173 aa  152  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1648  membrane protein of unknown function UCP014873  55.19 
 
 
168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0656  hypothetical protein  45.56 
 
 
182 aa  147  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2287  hypothetical protein  53.38 
 
 
193 aa  144  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0077  hypothetical protein  52.1 
 
 
179 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1191  hypothetical protein  46.71 
 
 
232 aa  140  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0472376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1351  membrane protein of uknown function UCP014873  46.71 
 
 
202 aa  140  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  46.58 
 
 
166 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5123  membrane protein of uknown function UCP014873  46.71 
 
 
206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.305727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0848  hypothetical protein  46.39 
 
 
173 aa  139  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2210  hypothetical protein  52.23 
 
 
166 aa  136  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270065 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1980  hypothetical protein  42.86 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.426393  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2446  hypothetical protein  51.81 
 
 
174 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000526152  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2201  hypothetical protein  50.89 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2887  hypothetical protein  46.71 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1917  membrane protein of uknown function UCP014873  43.95 
 
 
163 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00615975  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1893  membrane protein of uknown function UCP014873  43.95 
 
 
163 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2312  hypothetical protein  53.33 
 
 
165 aa  127  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0906747  normal  0.167452 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0445  membrane protein of uknown function UCP014873  38.51 
 
 
163 aa  120  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1452  membrane protein of unknown function UCP014873  40.62 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4746  membrane protein of uknown function UCP014873  37.42 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3072  hypothetical protein  34.34 
 
 
167 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.328618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3069  hypothetical protein  35.9 
 
 
168 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.17224  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0592  hypothetical protein  53.33 
 
 
91 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4002  hypothetical protein  36.54 
 
 
148 aa  97.1  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1527  membrane protein of uknown function UCP014873  40.99 
 
 
163 aa  89.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1820  membrane protein of uknown function UCP014873  36.42 
 
 
162 aa  87.4  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0164172  normal  0.327909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4566  membrane protein of uknown function UCP014873  37.5 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0759  membrane protein of uknown function UCP014873  38.36 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3156  membrane protein of unknown function UCP014873  31.15 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0758  membrane protein of uknown function UCP014873  40.99 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4067  membrane protein of uknown function UCP014873  34.59 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.527907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0771  membrane protein of uknown function UCP014873  38.26 
 
 
168 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3602  membrane protein of unknown function UCP014873  31.29 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3580  hypothetical protein  28.97 
 
 
213 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7012  hypothetical protein  27.5 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.519975  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6026  hypothetical protein  27.5 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0614455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1393  hypothetical protein  27.5 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6436  hypothetical protein  27.5 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0847  membrane protein-like  28.8 
 
 
255 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1377  membrane protein-like  45.95 
 
 
56 aa  41.2  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>