More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3730 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  82.12 
 
 		 151 aa  265  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  82.12 
 
 		 151 aa  265  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  76.82 
 
 		 151 aa  242  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2985  50S ribosomal protein L13  77.85 
 
 		 151 aa  242  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  72.85 
 
 		 151 aa  240  3.9999999999999997e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  75 
 
 		 151 aa  236  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  73.15 
 
 		 149 aa  234  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  70.14 
 
 		 150 aa  228  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  68.97 
 
 		 150 aa  227  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  70.34 
 
 		 170 aa  228  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  68.97 
 
 		 150 aa  227  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  68.75 
 
 		 150 aa  226  7e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 150 aa  224  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  70.92 
 
 		 143 aa  219  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  70.92 
 
 		 143 aa  219  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  70.21 
 
 		 143 aa  218  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  68.79 
 
 		 143 aa  215  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 142 aa  191  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 142 aa  189  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 142 aa  189  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 142 aa  189  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 142 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 142 aa  187  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  61.15 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  61.15 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  62.14 
 
 		 143 aa  184  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  61.11 
 
 		 146 aa  183  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 145 aa  183  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  56.94 
 
 		 145 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  57.64 
 
 		 145 aa  181  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  60.84 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  60.9 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  60.84 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  61.15 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 144 aa  179  8.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0434  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0288817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  60.43 
 
 		 143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  56.94 
 
 		 147 aa  178  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  61.36 
 
 		 144 aa  177  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 149 aa  177  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 144 aa  177  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  60.61 
 
 		 144 aa  177  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  64.62 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  56.76 
 
 		 148 aa  177  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  58.21 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  177  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  177  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  60.28 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0252  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  176  9e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000674786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 148 aa  176  9e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1941  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  176  9e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.62792e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 146 aa  176  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  58.65 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  54.86 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  56.94 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  58.16 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>