More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3723 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3723  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 67 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0711  translation initiation factor IF-1  96.97 
 
 		 74 aa  133  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000362397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2992  translation initiation factor IF-1  96.97 
 
 		 74 aa  133  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2579  translation initiation factor IF-1  96.97 
 
 		 74 aa  133  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.243719  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1312  translation initiation factor IF-1  95.45 
 
 		 74 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.108243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  94.03 
 
 		 75 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  94.03 
 
 		 75 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  76.92 
 
 		 73 aa  110  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  75 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  79.69 
 
 		 73 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  78.12 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  105  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1115  translation initiation factor IF-1  73.44 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000159264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  70.15 
 
 		 75 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  76.56 
 
 		 73 aa  104  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296746  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  73.44 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  76.56 
 
 		 73 aa  104  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  73.44 
 
 		 72 aa  104  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 73 aa  104  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  76.56 
 
 		 73 aa  104  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  70.31 
 
 		 72 aa  103  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  70.31 
 
 		 72 aa  103  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  103  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1927  translation initiation factor IF-1  73.02 
 
 		 72 aa  103  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3117  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 73 aa  103  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01031  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 78 aa  103  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00987912  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0217  translation initiation factor IF-1  70.31 
 
 		 71 aa  103  8e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.425198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06135  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 78 aa  103  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0613852  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4295  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 73 aa  103  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  68.75 
 
 		 72 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 73 aa  102  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  70.31 
 
 		 72 aa  102  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  73.44 
 
 		 72 aa  102  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3880  translation initiation factor IF-1  73.44 
 
 		 73 aa  102  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  70.31 
 
 		 72 aa  102  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4007  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.676038  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3352  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0756524  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3612  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3182  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142859  normal  0.0830693 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3589  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  67.19 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2392  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0976  translation initiation factor IF-1  69.23 
 
 		 74 aa  102  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.844523  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2588  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1113  translation initiation factor IF-1  73.44 
 
 		 73 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508115  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1826  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.904504  normal  0.0323919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  70.31 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28260  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  68.75 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  68.75 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30240  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0718  translation initiation factor 1  70.31 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0609  translation initiation factor IF-1  73.44 
 
 		 73 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3411  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.209503 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  73.44 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  73.44 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0288  translation initiation factor IF-1  70.97 
 
 		 80 aa  101  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  70.31 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0959  translation initiation factor IF-1  73.44 
 
 		 73 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3259  translation initiation factor IF-1  70.31 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.015028  hitchhiker  0.0000000000497253 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0421  translation initiation factor IF-1  73.44 
 
 		 74 aa  101  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  68.75 
 
 		 72 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1837  translation initiation factor IF-1  73.44 
 
 		 72 aa  100  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0378537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 72 aa  100  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0711  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 73 aa  100  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0309  translation initiation factor IF-1  73.44 
 
 		 72 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.776821  normal  0.33267 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  70.31 
 
 		 72 aa  100  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 73 aa  100  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000341025  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  70.31 
 
 		 72 aa  100  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1371  translation initiation factor IF-1  68.75 
 
 		 74 aa  100  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000257403  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29500  translation initiation factor 1  70.31 
 
 		 73 aa  100  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1315  translation initiation factor IF-1  68.75 
 
 		 74 aa  100  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000270736  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2630  translation initiation factor IF-1  70.31 
 
 		 73 aa  100  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  69.23 
 
 		 73 aa  100  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0588  translation initiation factor IF-1  71.88 
 
 		 73 aa  100  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0713  translation initiation factor IF-1  70.31 
 
 		 72 aa  100  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0497  translation initiation factor IF-1  69.23 
 
 		 73 aa  100  9e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000154065  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0650  translation initiation factor IF-1  70.31 
 
 		 73 aa  100  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_440  translation initiation factor 1 (IF-1)  69.23 
 
 		 73 aa  100  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000138941  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1829  translation initiation factor IF-1  65.62 
 
 		 72 aa  100  9e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0474  translation initiation factor IF-1  69.23 
 
 		 73 aa  100  9e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  67.19 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2439  translation initiation factor IF-1  70.31 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>