221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3649 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 109 aa  217  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  60.2 
 
 		 115 aa  130  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  56 
 
 		 104 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  56 
 
 		 104 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  53.33 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  44.23 
 
 		 111 aa  106  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 		 108 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  45.19 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  40.95 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1279  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  46.46 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0179706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  35.24 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  36 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  44.58 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  35.58 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.62 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  46.84 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  36.96 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  36.96 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  36.96 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  43.04 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.18 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  42.17 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0683  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0388  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0663  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  37.93 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  30.11 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  39.24 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  41.77 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 		 269 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  36.46 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  34.48 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  33.72 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  37.78 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  36.71 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  29.7 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0182  anti-sigma-factor antagonist  34.94 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  35.11 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  32.63 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3890  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0608567  decreased coverage  0.00481094 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  37.63 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  30.19 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1523  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  41.18 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.229071  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  28.04 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  42.86 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  31.25 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  35.9 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2691  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  34.94 
 
 		 332 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.721322  normal  0.111915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  31.25 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  32.29 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  32.29 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  32.29 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  32.29 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  31.25 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  32.29 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  33.33 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  29.46 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  29.46 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  29.46 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  29.46 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.25 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  29.46 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  29.46 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2518  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  36.25 
 
 		 350 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  29.46 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  32.88 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 250 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 116 aa  52.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  31.4 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  31.07 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.04 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  31.07 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  36.25 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>