More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3632 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 506 aa  1033    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  75.66 
 
 		 497 aa  767    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  68.73 
 
 		 513 aa  707    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  68.3 
 
 		 502 aa  701    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  75.66 
 
 		 497 aa  766    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  48.37 
 
 		 504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  48.88 
 
 		 512 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  45.7 
 
 		 515 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  47.36 
 
 		 512 aa  418  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  44.87 
 
 		 512 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  39.88 
 
 		 595 aa  356  5e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  40 
 
 		 509 aa  355  6.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  39.2 
 
 		 509 aa  349  7e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  38.8 
 
 		 509 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  40.12 
 
 		 509 aa  345  8e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  42.14 
 
 		 516 aa  345  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  41.19 
 
 		 511 aa  342  9e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  39.72 
 
 		 509 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  39.31 
 
 		 509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  40.28 
 
 		 554 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  40.12 
 
 		 510 aa  336  5e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  37.41 
 
 		 645 aa  317  3e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  36.06 
 
 		 506 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  38.98 
 
 		 598 aa  311  2e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 506 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  36.59 
 
 		 512 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  36.59 
 
 		 512 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  37.29 
 
 		 530 aa  308  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  36.62 
 
 		 508 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  34.88 
 
 		 520 aa  289  9e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  35.84 
 
 		 518 aa  289  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  35.05 
 
 		 518 aa  288  2e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  34.76 
 
 		 520 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  34.73 
 
 		 520 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  36 
 
 		 504 aa  287  4e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 		 532 aa  285  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 		 503 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  34.38 
 
 		 516 aa  283  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  35 
 
 		 507 aa  279  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  35 
 
 		 503 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  33.6 
 
 		 503 aa  276  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  33.73 
 
 		 508 aa  276  9e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  34.2 
 
 		 522 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  36.87 
 
 		 633 aa  275  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  33.4 
 
 		 505 aa  266  7e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  33.27 
 
 		 514 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  33.07 
 
 		 514 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  34.31 
 
 		 514 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  33.86 
 
 		 514 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  34.59 
 
 		 635 aa  223  4.9999999999999996e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  27.2 
 
 		 938 aa  191  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  27.5 
 
 		 518 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  26.76 
 
 		 493 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  26.86 
 
 		 518 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  26.86 
 
 		 518 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 501 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  26.93 
 
 		 499 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  25.87 
 
 		 507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  27.38 
 
 		 708 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 554 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  27.09 
 
 		 505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  26.46 
 
 		 511 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 717 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  27.16 
 
 		 501 aa  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  27.31 
 
 		 512 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  26.85 
 
 		 511 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  27.36 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  26.3 
 
 		 504 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  26.39 
 
 		 498 aa  128  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  26.94 
 
 		 546 aa  127  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  26.27 
 
 		 489 aa  126  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  25.73 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  26.2 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  26.7 
 
 		 711 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 496 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  27.06 
 
 		 505 aa  124  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 559 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 554 aa  124  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  27.52 
 
 		 504 aa  123  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  27.38 
 
 		 507 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  25.53 
 
 		 508 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.19 
 
 		 740 aa  121  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  27.31 
 
 		 494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  27.05 
 
 		 544 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  26.35 
 
 		 531 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  24.44 
 
 		 547 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  25.38 
 
 		 508 aa  120  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 722 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  25.92 
 
 		 531 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 		 484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  26.16 
 
 		 511 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  25.37 
 
 		 549 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  24.37 
 
 		 519 aa  117  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 		 531 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 547 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2352  FAD dependent oxidoreductase  23.62 
 
 		 495 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125181  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 510 aa  114  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  25.78 
 
 		 535 aa  114  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  25.05 
 
 		 506 aa  114  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>