More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3628 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
320 aa  618  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  68.12 
 
 
343 aa  411  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  68.12 
 
 
343 aa  411  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  46.86 
 
 
449 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  40.71 
 
 
340 aa  178  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  40.17 
 
 
351 aa  172  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  42.07 
 
 
309 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  37.54 
 
 
332 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  40.45 
 
 
381 aa  169  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  39.09 
 
 
333 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  44.14 
 
 
311 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  43.24 
 
 
517 aa  155  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  45.75 
 
 
493 aa  154  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  35.88 
 
 
336 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  35.88 
 
 
336 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  37.14 
 
 
319 aa  148  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  41.3 
 
 
521 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  40.94 
 
 
294 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  40.55 
 
 
291 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  40.55 
 
 
291 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  40.98 
 
 
576 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  35.88 
 
 
862 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  39.72 
 
 
268 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  36.09 
 
 
448 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 
489 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  39.86 
 
 
264 aa  132  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  43.69 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  34.25 
 
 
401 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  34.62 
 
 
389 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  34.88 
 
 
401 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  34.88 
 
 
401 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  40.74 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  32.8 
 
 
440 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  44.56 
 
 
213 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  42.03 
 
 
227 aa  126  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  35.74 
 
 
401 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  44.81 
 
 
386 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  37.13 
 
 
483 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  35.96 
 
 
493 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0477  pentapeptide repeat protein  41.85 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  35.62 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  42.86 
 
 
234 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  39.29 
 
 
267 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  38.03 
 
 
184 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  42.45 
 
 
225 aa  119  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  40.47 
 
 
567 aa  119  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  38.62 
 
 
237 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  45.19 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  41.4 
 
 
184 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  33.86 
 
 
734 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  34.53 
 
 
309 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  44.04 
 
 
214 aa  116  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  37.97 
 
 
233 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  37.97 
 
 
233 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  36.86 
 
 
1191 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  40.09 
 
 
441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  47.34 
 
 
1033 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  37.82 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  41.98 
 
 
219 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  36.65 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  32.65 
 
 
420 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  46.6 
 
 
745 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  31.53 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  30.59 
 
 
419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 
262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  41.53 
 
 
241 aa  108  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 
363 aa  108  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  39.74 
 
 
776 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  32.99 
 
 
515 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 
356 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  43.18 
 
 
266 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  39.74 
 
 
278 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  31.02 
 
 
412 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  44.3 
 
 
234 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  44.3 
 
 
234 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  49.04 
 
 
277 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  43.41 
 
 
356 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  40.78 
 
 
218 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  37.19 
 
 
300 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  42.35 
 
 
263 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  40.95 
 
 
213 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  34.3 
 
 
600 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  28.81 
 
 
348 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  39.13 
 
 
433 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  28.34 
 
 
949 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  38.61 
 
 
179 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  37.82 
 
 
727 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  30.65 
 
 
872 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  31.96 
 
 
872 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  42.46 
 
 
165 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  38.1 
 
 
189 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  45.09 
 
 
416 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  28.95 
 
 
844 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  38.74 
 
 
254 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  46.01 
 
 
903 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  35.68 
 
 
312 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  45.61 
 
 
182 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  37.97 
 
 
710 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  35.64 
 
 
870 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  36.95 
 
 
250 aa  100  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>