56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3623 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  100 
 
 
514 aa  1017    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  40.57 
 
 
815 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.71 
 
 
606 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  50.34 
 
 
595 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5615  hypothetical protein  50 
 
 
269 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  48.98 
 
 
808 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  37.88 
 
 
643 aa  101  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.74 
 
 
693 aa  99  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.47 
 
 
638 aa  94.7  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  24.81 
 
 
728 aa  90.1  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  25.75 
 
 
1202 aa  89  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  28.23 
 
 
675 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 
427 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  26.36 
 
 
560 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7127  hypothetical protein  36.05 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  23.83 
 
 
996 aa  71.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  26.95 
 
 
1001 aa  71.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0518  hypothetical protein  32.52 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  28.52 
 
 
960 aa  70.1  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  27.66 
 
 
403 aa  69.7  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  28.32 
 
 
658 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0494  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  32.85 
 
 
171 aa  67.8  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0009  hypothetical protein  32.64 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.115503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0897  hypothetical protein  30.46 
 
 
483 aa  66.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  25.64 
 
 
769 aa  64.7  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  26.64 
 
 
713 aa  63.9  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  27.34 
 
 
581 aa  63.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  27.72 
 
 
971 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0651  surface antigen  32.19 
 
 
232 aa  61.2  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  29.88 
 
 
669 aa  60.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  29.45 
 
 
416 aa  60.8  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  23.38 
 
 
938 aa  60.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  27.55 
 
 
379 aa  60.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  29.41 
 
 
1042 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0223  surface antigen  31.33 
 
 
207 aa  57.8  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1578  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  25.09 
 
 
448 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.486208  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  28.29 
 
 
374 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1708  surface antigen  30.57 
 
 
256 aa  55.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.63868  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1183  hypothetical protein  31.11 
 
 
633 aa  55.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0802936  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1519  hypothetical protein  28.87 
 
 
176 aa  55.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00366032  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  21.83 
 
 
1361 aa  54.7  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  25.4 
 
 
1279 aa  54.7  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1630  surface antigen  31.91 
 
 
290 aa  54.3  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000382803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0110  surface antigen  37.65 
 
 
152 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3268  hypothetical protein  28.02 
 
 
329 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0855187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.87 
 
 
407 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  32.56 
 
 
292 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  27.38 
 
 
303 aa  48.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  25.38 
 
 
819 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  25.21 
 
 
427 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  25.68 
 
 
685 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  26.29 
 
 
435 aa  45.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1614  surface antigen  33.33 
 
 
144 aa  44.7  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000315849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  28.06 
 
 
679 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  24.56 
 
 
432 aa  43.9  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1215  membrane attack complex component/perforin/complement C9  26.9 
 
 
466 aa  43.5  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.18029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>