101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3603 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 593 aa  1209    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  87.18 
 
 		 591 aa  1051    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  46.64 
 
 		 586 aa  498  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  46.56 
 
 		 581 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  46.64 
 
 		 586 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  46.56 
 
 		 581 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  45.68 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  38.47 
 
 		 641 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  40.98 
 
 		 581 aa  355  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  39.43 
 
 		 572 aa  349  6e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  43 
 
 		 491 aa  348  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  36.61 
 
 		 542 aa  338  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  40.23 
 
 		 550 aa  337  3.9999999999999995e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  36.35 
 
 		 539 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  35.25 
 
 		 639 aa  333  6e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  33.23 
 
 		 589 aa  313  3.9999999999999997e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  37.22 
 
 		 531 aa  300  7e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  33.43 
 
 		 666 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  33.04 
 
 		 658 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  33.43 
 
 		 666 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  36.14 
 
 		 530 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  35.48 
 
 		 574 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  36.97 
 
 		 529 aa  284  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  36.99 
 
 		 533 aa  282  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  38.05 
 
 		 550 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  44.35 
 
 		 645 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  33.55 
 
 		 561 aa  272  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  44.08 
 
 		 632 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  34.12 
 
 		 508 aa  263  8e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  34.99 
 
 		 563 aa  260  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  34.8 
 
 		 622 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  33.21 
 
 		 606 aa  246  8e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  33.33 
 
 		 604 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  34.29 
 
 		 624 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  30.28 
 
 		 600 aa  229  8e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  32.93 
 
 		 543 aa  226  9e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  31.86 
 
 		 571 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  33.53 
 
 		 518 aa  223  4.9999999999999996e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  33.4 
 
 		 531 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  32.66 
 
 		 548 aa  221  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  33.21 
 
 		 578 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  29.95 
 
 		 643 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  32.73 
 
 		 629 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  29.73 
 
 		 524 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  30.36 
 
 		 514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  30.95 
 
 		 561 aa  174  5e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  29.29 
 
 		 500 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  28.34 
 
 		 513 aa  170  8e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  29.37 
 
 		 510 aa  169  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  30.58 
 
 		 543 aa  168  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  29.32 
 
 		 568 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  29.83 
 
 		 528 aa  160  8e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  36.34 
 
 		 475 aa  154  5e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  29.92 
 
 		 518 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  28.6 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  27.94 
 
 		 531 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  33.63 
 
 		 555 aa  143  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  42.47 
 
 		 544 aa  130  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  48.82 
 
 		 188 aa  123  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  71.01 
 
 		 261 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  36.59 
 
 		 262 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  36.59 
 
 		 262 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  35.33 
 
 		 515 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  32.61 
 
 		 515 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  23.73 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  28.91 
 
 		 485 aa  72  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  38.1 
 
 		 946 aa  68.2  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  36.45 
 
 		 932 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  27.39 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  33.61 
 
 		 416 aa  62  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  37.5 
 
 		 919 aa  61.2  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  27.27 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  35.9 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  36.44 
 
 		 673 aa  56.6  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  34.83 
 
 		 255 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  38.71 
 
 		 361 aa  54.7  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  40 
 
 		 343 aa  54.3  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  23.73 
 
 		 432 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  37.89 
 
 		 424 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  49.02 
 
 		 575 aa  50.8  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  28.87 
 
 		 784 aa  50.8  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  46.67 
 
 		 1036 aa  49.7  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  28.97 
 
 		 330 aa  50.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  37.14 
 
 		 1821 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  27.85 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  39.34 
 
 		 400 aa  48.5  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  39.34 
 
 		 400 aa  48.5  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  21.83 
 
 		 437 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  42.11 
 
 		 506 aa  48.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  48.89 
 
 		 548 aa  47.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  36.84 
 
 		 403 aa  46.6  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  36.84 
 
 		 403 aa  46.6  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  25.16 
 
 		 426 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  32.73 
 
 		 375 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  34.33 
 
 		 536 aa  46.2  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  25 
 
 		 415 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  36.36 
 
 		 441 aa  44.7  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  51.28 
 
 		 457 aa  44.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  39.13 
 
 		 468 aa  44.3  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  40 
 
 		 413 aa  44.3  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>