60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3577 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3577  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  100 
 
 
248 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0546  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase-like protein  64.14 
 
 
249 aa  325  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0529  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  64.14 
 
 
249 aa  325  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4023  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  53.91 
 
 
260 aa  276  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1353  hypothetical protein  48.73 
 
 
251 aa  236  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.562603  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1838  hypothetical protein  51.25 
 
 
243 aa  233  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0024  hypothetical protein  50.24 
 
 
250 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1844  hypothetical protein  33.05 
 
 
237 aa  158  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1660  hypothetical protein  33.75 
 
 
237 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000295507  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1906  hypothetical protein  36.8 
 
 
246 aa  151  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32779  normal  0.659216 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00871  hypothetical protein  35.32 
 
 
259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0634  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.22 
 
 
237 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2528  hypothetical protein  31.9 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.333422  normal  0.549584 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1223  hypothetical protein  29.36 
 
 
248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102952  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0216  hypothetical protein  29.87 
 
 
267 aa  125  7e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0116  hypothetical protein  31.22 
 
 
246 aa  125  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.027363  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20991  hypothetical protein  32.38 
 
 
248 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.449797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3276  hypothetical protein  48.96 
 
 
102 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582387 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01301  hypothetical protein  25.62 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.627797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3559  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.19 
 
 
254 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4224  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.55 
 
 
252 aa  89.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.851728  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1454  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.84 
 
 
252 aa  87.8  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0223  hypothetical protein  26.79 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000261911  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0730  hypothetical protein  27.48 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0412  hypothetical protein  27.04 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4381  hypothetical protein  25.71 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3511  hypothetical protein  26.96 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2682  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.23 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3421  hypothetical protein  24.23 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.449805  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14301  hypothetical protein  31.54 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4385  hypothetical protein  26.63 
 
 
252 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.016831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2846  hypothetical protein  25 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3275  hypothetical protein  25 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4001  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.35 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5022  hypothetical protein  25.93 
 
 
261 aa  55.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3835  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.44 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.834498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0474  putative peptidyl-prolyl isomerase  22.91 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139387  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0928  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.58 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.496097  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0154  putative PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.79 
 
 
313 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0911  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.03 
 
 
354 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.159559  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0437  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.27 
 
 
493 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0199  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.18 
 
 
317 aa  45.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000517343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5133  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.45 
 
 
426 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0268  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.23 
 
 
631 aa  45.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0142  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.7 
 
 
345 aa  45.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.08 
 
 
442 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0015  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  25.45 
 
 
321 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0216  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.73 
 
 
317 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000196807  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1262  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.57 
 
 
343 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2124  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.99 
 
 
277 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1690  SurA domain protein  23.44 
 
 
311 aa  42.7  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0553768 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0498  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.64 
 
 
499 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.307717  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0287  SurA domain protein  25.84 
 
 
320 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416052 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21140  peptidil-prolyl cis-trans isomerase  29.76 
 
 
332 aa  42.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0289  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.55 
 
 
384 aa  42.4  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3637  survival protein surA  31.68 
 
 
434 aa  42.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5680  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.77 
 
 
277 aa  42.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3207  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.68 
 
 
434 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00341514  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5445  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.27 
 
 
245 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306493  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3113  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.68 
 
 
434 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.980889  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>