More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3496 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  100 
 
 
565 aa  1125    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  46.06 
 
 
578 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  46.06 
 
 
578 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  46.54 
 
 
731 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  44.8 
 
 
972 aa  372  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  43.5 
 
 
635 aa  360  5e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  43.59 
 
 
525 aa  323  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  48.32 
 
 
627 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  36.17 
 
 
576 aa  239  6.999999999999999e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02231  RND family outer membrane efflux protein  35.52 
 
 
577 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  34.53 
 
 
594 aa  219  7.999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0360  RND family outer membrane efflux protein  33.6 
 
 
574 aa  209  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1465  outer membrane efflux protein  32.32 
 
 
526 aa  160  8e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.505044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01671  RND family outer membrane efflux protein  32.01 
 
 
526 aa  156  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01101  RND family outer membrane efflux protein  27 
 
 
505 aa  136  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01091  RND family outer membrane efflux protein  27.19 
 
 
476 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01131  RND family outer membrane efflux protein  23.57 
 
 
475 aa  116  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245379  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01121  RND family outer membrane efflux protein  24.52 
 
 
475 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0101  RND family outer membrane efflux protein-like  23.04 
 
 
477 aa  113  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1181  Outer membrane protein-like  25.53 
 
 
606 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  26.44 
 
 
453 aa  109  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 
427 aa  106  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 
467 aa  100  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 
482 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  26.05 
 
 
435 aa  99.4  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  25.29 
 
 
435 aa  97.1  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.81 
 
 
1470 aa  94.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 
458 aa  94  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  22.52 
 
 
418 aa  92.8  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 
433 aa  87.8  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  23.58 
 
 
451 aa  87.4  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  26 
 
 
460 aa  87.4  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  24.51 
 
 
535 aa  87.4  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  25.23 
 
 
491 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  22.84 
 
 
470 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  25.64 
 
 
439 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.04 
 
 
1496 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  26.13 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  24.88 
 
 
453 aa  84  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  25.36 
 
 
419 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  24.11 
 
 
462 aa  80.5  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  29.01 
 
 
446 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  22.17 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  24.04 
 
 
463 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  29.32 
 
 
461 aa  77  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  26.98 
 
 
449 aa  75.1  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  22.3 
 
 
471 aa  74.3  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 
463 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 
456 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  23.22 
 
 
455 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  24.58 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  27.48 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  28.22 
 
 
455 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 
496 aa  72  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  22.73 
 
 
483 aa  71.6  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  25.47 
 
 
462 aa  70.9  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 
459 aa  70.9  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  23.62 
 
 
463 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  27.47 
 
 
497 aa  70.5  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1773  outer membrane efflux protein  20.71 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  24.24 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  19.85 
 
 
448 aa  67  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  26.37 
 
 
448 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 
449 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  21.15 
 
 
441 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.98 
 
 
441 aa  64.7  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.37 
 
 
471 aa  64.7  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  26.67 
 
 
445 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 
446 aa  64.7  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.79 
 
 
452 aa  64.7  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  22.66 
 
 
426 aa  63.9  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  24.86 
 
 
431 aa  63.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  23.95 
 
 
447 aa  63.5  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  25.49 
 
 
476 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  25.08 
 
 
421 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  22.79 
 
 
443 aa  63.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 
440 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  25.24 
 
 
445 aa  62.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  26.75 
 
 
497 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 
490 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  21.53 
 
 
440 aa  62.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  22.72 
 
 
454 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  25 
 
 
503 aa  62  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  25.43 
 
 
431 aa  62  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  29.1 
 
 
454 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 
421 aa  61.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1477  outer membrane efflux protein  28.46 
 
 
454 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  25.69 
 
 
501 aa  60.8  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  24.92 
 
 
457 aa  60.8  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2832  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.1 
 
 
520 aa  60.8  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  21.96 
 
 
438 aa  60.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1941  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.94 
 
 
497 aa  60.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211357  normal  0.0401761 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0836  outer membrane efflux protein  27.73 
 
 
446 aa  60.1  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.25 
 
 
474 aa  60.1  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0309  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 
458 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 
447 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0887  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.03 
 
 
586 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000421492  hitchhiker  0.0000263613 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 
506 aa  59.3  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  22.08 
 
 
472 aa  58.9  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0192834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>