84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3484 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 115 aa  234  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  61.54 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  55.45 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  65.56 
 
 		 104 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  54.55 
 
 		 112 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  53.54 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  47.71 
 
 		 109 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  46.39 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  46.39 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  46.79 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  44.66 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  43.12 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  45.05 
 
 		 129 aa  93.6  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  48.39 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  48.39 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  45.05 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  40.68 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  40.59 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  40.59 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  40.43 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  45.68 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  39.18 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  39.8 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  31.87 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  34.78 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  33 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  35.79 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  45.71 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  31.87 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  33.71 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  30.48 
 
 		 102 aa  52.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  30.48 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  31.87 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  41.56 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  25.71 
 
 		 270 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  36.25 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  36.25 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  36.92 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  40.98 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  35.94 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  32.71 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  33.96 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2568  hypothetical protein  56.25 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  28.89 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  36.71 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  32.93 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  32.93 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  43.1 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  35.94 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  32.35 
 
 		 189 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  34.18 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  31.51 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  34.18 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  32.91 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  27.78 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  27.38 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  37.29 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  40.32 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  29.67 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  34.72 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  31.03 
 
 		 96 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  33.9 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  33.9 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  28.79 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  29.17 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  32 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  26.37 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  32.84 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  36 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  31.15 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  30.77 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  29.87 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  28.77 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  32.76 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  30.67 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  36.11 
 
 		 98 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>