More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3392 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3392  single-strand binding protein  100 
 
 		 123 aa  253  8e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.196775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4171  single-strand binding protein  79.31 
 
 		 122 aa  189  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000225771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4131  single-strand binding protein  79.31 
 
 		 122 aa  189  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1149  single-stranded DNA-binding protein  68.1 
 
 		 119 aa  170  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499901 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1462  single-stranded DNA-binding protein  68.75 
 
 		 120 aa  161  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000299636  hitchhiker  0.000565917 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0104  single-stranded DNA-binding protein  66.97 
 
 		 125 aa  158  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0148  single-stranded DNA-binding protein  63.56 
 
 		 125 aa  158  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0865  single-strand-binding protein  65 
 
 		 120 aa  157  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0459658  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01781  single-stranded DNA-binding protein  66.36 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20751  single-stranded DNA-binding protein  64.49 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1200  single-stranded DNA-binding protein  64.49 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17491  single-stranded DNA-binding protein  59.35 
 
 		 127 aa  151  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.932532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18331  single-stranded DNA-binding protein  59.81 
 
 		 123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18151  single-stranded DNA-binding protein  59.81 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18121  single-stranded DNA-binding protein  58.72 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  hitchhiker  0.00558651  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1716  single-stranded DNA-binding protein  58.88 
 
 		 133 aa  143  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  62.04 
 
 		 120 aa  143  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1469  single-strand binding protein  61.68 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.254699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5420  single-strand binding protein  50.85 
 
 		 135 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0119  single-strand binding protein  40.18 
 
 		 127 aa  97.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16725  predicted protein  39.82 
 
 		 115 aa  92  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  36.7 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  39.05 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  40 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  36.22 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  34.55 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  33.9 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 188 aa  80.5  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1771  single-strand binding protein  34.55 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0689148  normal  0.0680563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  37.17 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  35.94 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  32 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  36.04 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  36.7 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  36.61 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  33.91 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  37.61 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  35.96 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  39.25 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  34.38 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  37.07 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  40.95 
 
 		 188 aa  76.6  0.00000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  36.19 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  35.45 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  34.43 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  41.38 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  31.48 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  32.26 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  35.43 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4323  single-strand binding protein  34.19 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  32.52 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  29.03 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  36.27 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  35.14 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  33.06 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  32.41 
 
 		 225 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  32.46 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  33.02 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  32.74 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  35.04 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  32.17 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  36.52 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  30.56 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  29.63 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  35.87 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2378  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.14117e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  30.95 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  32.81 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  35 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  34.23 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  35.87 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  35.45 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2049  single-strand binding protein  31.9 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  36.04 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  33.07 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  37.39 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  36.61 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  33.91 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  30.91 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  36.07 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  32.73 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  34.48 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  34.55 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>