277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3390 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 257 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  60.8 
 
 		 249 aa  323  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  60.8 
 
 		 249 aa  323  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  49.79 
 
 		 251 aa  244  6.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  50.82 
 
 		 256 aa  231  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  50.2 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  45.38 
 
 		 265 aa  226  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  45.45 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0150  rod shape-determining protein MreC  45.07 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  43.84 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01801  rod shape-determining protein MreC  40 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  37.02 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  35.96 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  35.53 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  35.78 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  35.61 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  31.85 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18131  rod shape-determining protein MreC  31.71 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570389  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  41.07 
 
 		 273 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  33.68 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  33.97 
 
 		 275 aa  111  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  30.88 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  31.76 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  30.88 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  29.7 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  30.48 
 
 		 317 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  35.05 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  34.78 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  34.5 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  32.54 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  32.57 
 
 		 304 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  35.67 
 
 		 310 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  32.11 
 
 		 300 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  32.57 
 
 		 300 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  33.16 
 
 		 304 aa  95.9  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  35.03 
 
 		 273 aa  95.5  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  35.03 
 
 		 317 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 		 315 aa  92.8  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  28.37 
 
 		 309 aa  92.4  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  31.34 
 
 		 283 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  32.18 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  32.18 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 		 285 aa  90.5  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 		 287 aa  90.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  31.2 
 
 		 357 aa  90.9  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  34.69 
 
 		 359 aa  90.1  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  32.8 
 
 		 283 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  30.24 
 
 		 288 aa  90.1  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  32.48 
 
 		 281 aa  89.7  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  31.41 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  28.99 
 
 		 281 aa  89.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  32.7 
 
 		 292 aa  89  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  32.75 
 
 		 293 aa  88.6  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  24.58 
 
 		 281 aa  88.6  8e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  34.46 
 
 		 311 aa  88.6  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  33.51 
 
 		 283 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  32.03 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  33.51 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  28.4 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  31.21 
 
 		 294 aa  86.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  27.37 
 
 		 283 aa  86.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  33.16 
 
 		 283 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  35.06 
 
 		 272 aa  86.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  32.07 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 306 aa  85.5  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  33.73 
 
 		 334 aa  85.5  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 		 291 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  29.95 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  29.95 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  32.16 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  32.66 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  25.79 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  30.29 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  25.79 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  30.36 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  35.87 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  26.46 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  29.74 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  30.15 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  28.72 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  32.26 
 
 		 283 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  27.85 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  34.5 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  33.13 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0286  rod shape-determining protein MreC  27.36 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  26.38 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  29.32 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  27.06 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  29.11 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  29.56 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  26.37 
 
 		 348 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  27.32 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  27.32 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  29.05 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0839  Rod shape-determining protein MreC  32.93 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>