More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3245 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 947 aa  1906    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  49.2 
 
 		 1163 aa  707    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  46 
 
 		 1363 aa  786    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  43.84 
 
 		 1652 aa  593  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  46.15 
 
 		 1236 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  47.29 
 
 		 696 aa  551  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.12 
 
 		 1686 aa  546  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  40.37 
 
 		 1656 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  38.9 
 
 		 1523 aa  519  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  35.86 
 
 		 1348 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  44.46 
 
 		 1557 aa  510  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  41.93 
 
 		 1789 aa  505  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.45 
 
 		 1711 aa  505  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  44.13 
 
 		 1474 aa  500  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  39.95 
 
 		 1510 aa  498  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 1221 aa  496  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  46.76 
 
 		 1553 aa  497  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.8 
 
 		 1481 aa  489  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  49.34 
 
 		 1364 aa  483  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  47.33 
 
 		 1443 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  39.48 
 
 		 1454 aa  476  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  43.52 
 
 		 1196 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  41.91 
 
 		 1188 aa  469  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.44 
 
 		 919 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  42.66 
 
 		 1661 aa  462  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  38.14 
 
 		 1552 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  40.03 
 
 		 1357 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  40.51 
 
 		 1868 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  39.07 
 
 		 1193 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  33.1 
 
 		 1373 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  37.3 
 
 		 1367 aa  439  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  35.93 
 
 		 1831 aa  439  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 1190 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.77 
 
 		 1760 aa  430  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  35.15 
 
 		 1161 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  35.02 
 
 		 1161 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.66 
 
 		 1262 aa  426  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  43.44 
 
 		 1247 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  35.64 
 
 		 1164 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  41.3 
 
 		 1229 aa  412  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  37.81 
 
 		 1714 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  36.19 
 
 		 1213 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  37.14 
 
 		 1217 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  34.63 
 
 		 1177 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  35.99 
 
 		 1211 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  34.55 
 
 		 1176 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  36.45 
 
 		 1208 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  29.85 
 
 		 1016 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.16 
 
 		 930 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  29.95 
 
 		 1016 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  32.94 
 
 		 1901 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.46 
 
 		 1598 aa  383  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.67 
 
 		 1609 aa  379  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.3 
 
 		 1626 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.18 
 
 		 1583 aa  369  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.3 
 
 		 1547 aa  366  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  29.67 
 
 		 1279 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  29.58 
 
 		 1279 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.22 
 
 		 1617 aa  362  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  38.45 
 
 		 1858 aa  357  3.9999999999999996e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.48 
 
 		 1607 aa  357  6.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.54 
 
 		 1684 aa  356  8.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  33.39 
 
 		 1416 aa  355  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.35 
 
 		 1599 aa  349  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  33.62 
 
 		 1807 aa  347  8e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.63 
 
 		 924 aa  346  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  34.38 
 
 		 728 aa  344  4e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  30.63 
 
 		 1242 aa  342  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  36.22 
 
 		 1188 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  33.09 
 
 		 1280 aa  335  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  32.56 
 
 		 1344 aa  333  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  33.17 
 
 		 608 aa  312  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  43.19 
 
 		 1599 aa  311  4e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.26 
 
 		 1623 aa  311  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.81 
 
 		 1856 aa  310  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  34.89 
 
 		 1411 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  32.48 
 
 		 1041 aa  301  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  29.56 
 
 		 1214 aa  300  7e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  31.82 
 
 		 1330 aa  300  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.38 
 
 		 1039 aa  300  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  46.31 
 
 		 344 aa  299  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  53.63 
 
 		 676 aa  298  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  45.43 
 
 		 344 aa  298  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  35.16 
 
 		 1311 aa  297  7e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.52 
 
 		 1004 aa  297  7e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  28.02 
 
 		 1190 aa  295  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  31.54 
 
 		 1264 aa  295  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  31.54 
 
 		 1264 aa  295  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  31 
 
 		 1399 aa  294  6e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  29.17 
 
 		 1209 aa  292  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.7 
 
 		 1267 aa  291  5.0000000000000004e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  41.94 
 
 		 1878 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  50.17 
 
 		 682 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  28.65 
 
 		 1484 aa  285  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.38 
 
 		 740 aa  284  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  45.48 
 
 		 677 aa  284  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  32.91 
 
 		 505 aa  279  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.85 
 
 		 1240 aa  279  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  32.03 
 
 		 1304 aa  276  9e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  27.53 
 
 		 1209 aa  273  8.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>