More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3227 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
375 aa  785    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2795  queuine tRNA-ribosyltransferase  79.51 
 
 
366 aa  627  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3305  queuine tRNA-ribosyltransferase  79.23 
 
 
366 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.423867 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  76.16 
 
 
384 aa  600  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.12 
 
 
387 aa  589  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.21 
 
 
394 aa  573  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2456  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.35 
 
 
367 aa  569  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.359127  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.73 
 
 
381 aa  564  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.71 
 
 
372 aa  484  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03501  tRNA-guanine transglycosylase  60.22 
 
 
376 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24901  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.81 
 
 
372 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1637  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.22 
 
 
376 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02981  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.1 
 
 
372 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0267  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.93 
 
 
372 aa  464  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02931  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.52 
 
 
372 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0273  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.97 
 
 
372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02941  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.97 
 
 
372 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.483841  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03041  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.31 
 
 
372 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.14 
 
 
380 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.74 
 
 
379 aa  421  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.77 
 
 
380 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.74 
 
 
379 aa  421  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.46 
 
 
379 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.01 
 
 
374 aa  414  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.65 
 
 
370 aa  411  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.22 
 
 
379 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.22 
 
 
379 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.3 
 
 
373 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.78 
 
 
379 aa  408  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.22 
 
 
379 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.06 
 
 
357 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.24 
 
 
379 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.04 
 
 
375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.94 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.94 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.94 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.94 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.94 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.81 
 
 
373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.94 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.94 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.65 
 
 
394 aa  402  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.83 
 
 
372 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.31 
 
 
368 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
369 aa  391  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.02 
 
 
372 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.99 
 
 
336 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.51 
 
 
369 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.91 
 
 
373 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.85 
 
 
370 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.59 
 
 
380 aa  385  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.74 
 
 
368 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.8 
 
 
384 aa  382  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.22 
 
 
368 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.54 
 
 
368 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.22 
 
 
368 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
365 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.79 
 
 
392 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.09 
 
 
383 aa  380  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.45 
 
 
382 aa  380  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.87 
 
 
380 aa  381  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
372 aa  377  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.56 
 
 
380 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.16 
 
 
372 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.57 
 
 
371 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.87 
 
 
372 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.7 
 
 
387 aa  369  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.45 
 
 
380 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.25 
 
 
373 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.62 
 
 
384 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.74 
 
 
369 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.26 
 
 
367 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0330  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.27 
 
 
388 aa  364  1e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00349082 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 
372 aa  363  3e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.29 
 
 
373 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.29 
 
 
370 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.01 
 
 
388 aa  361  1e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.24 
 
 
376 aa  360  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.01 
 
 
371 aa  358  6e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1302  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.86 
 
 
400 aa  358  7e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.31 
 
 
380 aa  358  8e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.31 
 
 
380 aa  358  8e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4271  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
384 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0374277 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.29 
 
 
383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3296  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300958  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.71 
 
 
374 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.29 
 
 
383 aa  356  2.9999999999999997e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3270  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 
379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756074  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3071  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.28 
 
 
383 aa  356  5e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.46 
 
 
392 aa  356  5e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.15 
 
 
355 aa  355  5.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1231  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.17 
 
 
369 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.579512  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1224  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.17 
 
 
369 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.736515  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1752  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.5 
 
 
376 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543726  normal  0.0577466 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.19 
 
 
383 aa  354  1e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1268  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 
376 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236624  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1658  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.09 
 
 
405 aa  353  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193813 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.71 
 
 
367 aa  352  4e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2451  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.3 
 
 
376 aa  352  7e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0606971  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  49 
 
 
385 aa  351  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>