184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3195 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
132 aa  264  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  76.8 
 
 
133 aa  192  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  80.17 
 
 
116 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2424  anti-sigma-factor antagonist  80.17 
 
 
116 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  72.58 
 
 
130 aa  179  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  70.27 
 
 
114 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2283  anti-sigma-factor antagonist  70.97 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1306  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  48.36 
 
 
128 aa  104  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06941  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  47.79 
 
 
115 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00555121  normal  0.159245 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1153  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  50.86 
 
 
129 aa  98.6  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406028  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15781  STAS domain-containing protein  47.37 
 
 
118 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2311  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  67.69 
 
 
80 aa  91.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0655484 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0260  anti-anti-sigma regulatory factor  46.39 
 
 
99 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09291  STAS domain-containing protein  46.39 
 
 
99 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0243906 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  36.79 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  40.38 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  39.42 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  39.42 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  34.23 
 
 
120 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.63 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 
117 aa  57.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  33.7 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  29.79 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  31.96 
 
 
112 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 
249 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  27.66 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.29 
 
 
113 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  28.07 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  29.82 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 
118 aa  53.5  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 
107 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  31.63 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  36.46 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  35.79 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  27.08 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  32.99 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  23.66 
 
 
183 aa  51.6  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  27.08 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 
115 aa  51.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  26.04 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  34.09 
 
 
111 aa  50.8  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 
114 aa  50.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 
111 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  27.27 
 
 
151 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  30.09 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  30.09 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  30.09 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  30.09 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  30.09 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  30.09 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  26.21 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  30.09 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  29.06 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  31.87 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  30.09 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7044  anti-sigma-factor antagonist  26.09 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  34.44 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  30.09 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  29.57 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  29.33 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  25.45 
 
 
112 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0333  anti-sigma factor antagonist  29.51 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  27.03 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  29.2 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  30.11 
 
 
113 aa  47.8  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  30.97 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.23 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  27.72 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 
111 aa  47.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 
131 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  25.27 
 
 
122 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 
111 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  25.74 
 
 
108 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  31.11 
 
 
111 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  32.71 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  27.45 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>