More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3155 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1964  DNA mismatch repair protein  66.55 
 
 
561 aa  768    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0856  DNA mismatch repair protein  60.25 
 
 
563 aa  703    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1937  DNA mismatch repair protein  66.55 
 
 
561 aa  767    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2630  DNA mismatch repair protein MutL  59.15 
 
 
565 aa  674    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3155  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
566 aa  1160    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0504  DNA mismatch repair protein  57.98 
 
 
587 aa  686    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.768235  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3702  DNA mismatch repair protein  53.11 
 
 
575 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1780  DNA mismatch repair protein  48.67 
 
 
541 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.644143 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  31.09 
 
 
586 aa  244  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  31.13 
 
 
585 aa  243  5e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0293  DNA mismatch repair protein MutL  32.22 
 
 
532 aa  243  6e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  31.65 
 
 
559 aa  243  7.999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0034  DNA mismatch repair protein MutL  30.36 
 
 
590 aa  242  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  31.39 
 
 
620 aa  231  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  30.4 
 
 
605 aa  228  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  28.08 
 
 
628 aa  224  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  31.17 
 
 
599 aa  224  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  29.71 
 
 
611 aa  223  9e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  30.62 
 
 
603 aa  223  9e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  28.5 
 
 
588 aa  221  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  30.24 
 
 
605 aa  221  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  28.46 
 
 
602 aa  220  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  29.79 
 
 
611 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  29.65 
 
 
612 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  28.78 
 
 
622 aa  217  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  29.66 
 
 
566 aa  217  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  28.35 
 
 
619 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  29.61 
 
 
610 aa  214  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  28.02 
 
 
606 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  29.1 
 
 
594 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  30.27 
 
 
603 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  28.3 
 
 
600 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  29.17 
 
 
603 aa  211  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  28.84 
 
 
566 aa  211  4e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  28.64 
 
 
566 aa  210  7e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  29.23 
 
 
595 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  28.71 
 
 
603 aa  209  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  30.69 
 
 
575 aa  209  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  29.02 
 
 
589 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  30.69 
 
 
574 aa  208  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  27.74 
 
 
617 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  28.96 
 
 
597 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  28.16 
 
 
612 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  30.05 
 
 
582 aa  206  8e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  29.83 
 
 
572 aa  206  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  27.57 
 
 
602 aa  206  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  27.71 
 
 
599 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  29.23 
 
 
560 aa  204  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  27.83 
 
 
644 aa  204  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  27.65 
 
 
600 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  28.3 
 
 
605 aa  204  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  28.1 
 
 
605 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  30.24 
 
 
620 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  28.34 
 
 
597 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  29.38 
 
 
557 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  29.01 
 
 
616 aa  200  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  28.69 
 
 
584 aa  200  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  28.81 
 
 
611 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  28.41 
 
 
615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  28.8 
 
 
632 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  28.93 
 
 
617 aa  197  6e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  28.02 
 
 
625 aa  195  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  27.74 
 
 
603 aa  194  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0433  DNA mismatch repair protein MutL  30.98 
 
 
544 aa  194  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.397658  normal  0.543427 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  29.37 
 
 
621 aa  193  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  29.46 
 
 
652 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1538  DNA mismatch repair protein MutL  29.93 
 
 
549 aa  192  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186199  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1331  DNA mismatch repair protein MutL  29.63 
 
 
579 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1521  DNA mismatch repair protein MutL  29.81 
 
 
540 aa  191  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  37.94 
 
 
610 aa  191  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  27.16 
 
 
613 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  26.81 
 
 
612 aa  189  9e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1711  DNA mismatch repair protein MutL  28.31 
 
 
588 aa  188  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.619498  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  29.76 
 
 
604 aa  188  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  27.5 
 
 
606 aa  187  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  28.94 
 
 
601 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  24.64 
 
 
606 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  26.98 
 
 
633 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  27.23 
 
 
632 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  29.52 
 
 
595 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  29.52 
 
 
595 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  26.98 
 
 
633 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2227  MutL dimerisation  29.11 
 
 
584 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000451621  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0215  DNA mismatch repair protein MutL  24.88 
 
 
600 aa  184  5.0000000000000004e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0118368  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  29.57 
 
 
582 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 
630 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  28.17 
 
 
565 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  27.04 
 
 
608 aa  181  2.9999999999999997e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0007  DNA mismatch repair protein MutL  32.46 
 
 
709 aa  181  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953905  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  26.79 
 
 
630 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0376  DNA mismatch repair protein MutL  32.65 
 
 
709 aa  177  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.13305  normal  0.32452 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  36.36 
 
 
629 aa  176  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0769  DNA mismatch repair protein MutL  26.44 
 
 
551 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  32.3 
 
 
628 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_002978  WD0509  DNA mismatch repair protein  27.38 
 
 
598 aa  174  3.9999999999999995e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.587743  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0901  DNA mismatch repair protein MutL  28.7 
 
 
516 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  24.71 
 
 
589 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2752  DNA mismatch repair protein MutL  32.66 
 
 
576 aa  173  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0215  DNA mismatch repair protein MutL  27.22 
 
 
608 aa  172  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.137951 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  33.82 
 
 
640 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>