More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3129 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  65.08 
 
 		 200 aa  261  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  65.08 
 
 		 200 aa  261  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 205 aa  198  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 236 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 289 aa  173  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 228 aa  87.8  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 216 aa  84.7  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 218 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  32.12 
 
 		 224 aa  80.9  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  29.38 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  33.99 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  28.57 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
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NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  28.77 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  30.89 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  32.39 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
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NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  29.82 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
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NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 216 aa  72  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 238 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3455  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  31.55 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  28.42 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  29.76 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  39.47 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 217 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
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NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  31.39 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
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NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
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NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
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NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 540 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
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NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
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