66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3078 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2844  hypothetical protein  70.44 
 
 
692 aa  957    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.919934  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  75.93 
 
 
679 aa  1064    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  63.31 
 
 
669 aa  827    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  60.21 
 
 
696 aa  805    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  75.93 
 
 
679 aa  1065    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  60.21 
 
 
696 aa  805    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  59.94 
 
 
675 aa  796    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  68.16 
 
 
676 aa  959    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  56.99 
 
 
660 aa  696    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  100 
 
 
691 aa  1432    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0953  FAD dependent oxidoreductase  58.9 
 
 
661 aa  760    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  27.69 
 
 
619 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  26.74 
 
 
621 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  23.18 
 
 
514 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  25.27 
 
 
595 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  27.04 
 
 
549 aa  131  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  25.23 
 
 
531 aa  125  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.04 
 
 
540 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  24.84 
 
 
568 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  24.56 
 
 
532 aa  120  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  24.72 
 
 
530 aa  117  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  24.8 
 
 
532 aa  117  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  22.34 
 
 
534 aa  111  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  23.17 
 
 
537 aa  107  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  23.13 
 
 
527 aa  101  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 
538 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  26.39 
 
 
584 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  26.39 
 
 
584 aa  77.8  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  25.07 
 
 
595 aa  75.1  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  23.46 
 
 
599 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  22.02 
 
 
595 aa  69.3  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  26.26 
 
 
582 aa  67  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  43.28 
 
 
435 aa  63.9  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  31.4 
 
 
466 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  23.21 
 
 
595 aa  62  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  31.25 
 
 
624 aa  62  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  25.06 
 
 
601 aa  60.8  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  26.67 
 
 
758 aa  60.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  30.83 
 
 
748 aa  60.1  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  29.46 
 
 
764 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  33.33 
 
 
797 aa  59.3  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  30.63 
 
 
606 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  29.58 
 
 
672 aa  58.2  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 
475 aa  57  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  30.94 
 
 
641 aa  57  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  24.35 
 
 
585 aa  55.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  27.61 
 
 
600 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 
526 aa  54.7  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  32.56 
 
 
764 aa  53.9  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.98 
 
 
722 aa  52.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  34.31 
 
 
531 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  27.56 
 
 
757 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  29.91 
 
 
491 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  27.88 
 
 
457 aa  49.3  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  36.51 
 
 
454 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
464 aa  47.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3104  hypothetical protein  29.93 
 
 
558 aa  47.4  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000761845  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  32.99 
 
 
453 aa  46.6  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.05 
 
 
459 aa  46.2  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  26.45 
 
 
421 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  29.08 
 
 
784 aa  45.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  28.57 
 
 
618 aa  45.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.49 
 
 
472 aa  45.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2922  hypothetical protein  37.88 
 
 
625 aa  44.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
457 aa  44.3  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 
423 aa  43.9  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>