More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3045 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  100 
 
 
452 aa  928  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  67.42 
 
 
451 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  67.42 
 
 
451 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  62.3 
 
 
449 aa  585  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  61.17 
 
 
446 aa  577  1e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  60.18 
 
 
443 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  59.86 
 
 
443 aa  544  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  54.63 
 
 
451 aa  491  1e-138  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  40.76 
 
 
452 aa  333  5e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  43.32 
 
 
432 aa  332  7e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  44.55 
 
 
445 aa  330  3e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  39.64 
 
 
446 aa  328  2e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  43.78 
 
 
445 aa  325  9e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  39.78 
 
 
448 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  5.93735e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  38.16 
 
 
452 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  39.65 
 
 
457 aa  323  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  40.04 
 
 
452 aa  317  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  37.14 
 
 
448 aa  317  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  38.07 
 
 
453 aa  316  6e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  37.19 
 
 
444 aa  315  1e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  43.07 
 
 
450 aa  314  2e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  36.48 
 
 
455 aa  308  1e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  38.31 
 
 
448 aa  306  6e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  37.47 
 
 
468 aa  305  9e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  38.31 
 
 
448 aa  305  1e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  39.47 
 
 
453 aa  300  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  36.55 
 
 
449 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  38.22 
 
 
452 aa  298  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  36.69 
 
 
444 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  39.38 
 
 
437 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  39.95 
 
 
438 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  37.5 
 
 
447 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  39.69 
 
 
438 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  42.75 
 
 
448 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  43.01 
 
 
438 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  39.43 
 
 
438 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  38.56 
 
 
464 aa  286  6e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  38.11 
 
 
451 aa  285  8e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  34.6 
 
 
444 aa  283  5e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  34.82 
 
 
444 aa  282  7e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  34.82 
 
 
444 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  34.82 
 
 
444 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  34.82 
 
 
444 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  34.82 
 
 
444 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  34.6 
 
 
444 aa  280  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  34.97 
 
 
444 aa  279  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  33.26 
 
 
456 aa  279  7e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  34.6 
 
 
444 aa  279  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  36.3 
 
 
449 aa  279  9e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  34.6 
 
 
444 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  33.7 
 
 
462 aa  277  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  33.71 
 
 
444 aa  276  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  5.12112e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  38.22 
 
 
453 aa  270  5e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  32.13 
 
 
435 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  38.81 
 
 
429 aa  261  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  32.21 
 
 
440 aa  260  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  35.5 
 
 
451 aa  259  5e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  32.07 
 
 
442 aa  259  8e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  34.3 
 
 
449 aa  258  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  36.55 
 
 
447 aa  257  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  31.63 
 
 
442 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  36.15 
 
 
471 aa  256  6e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  35.12 
 
 
451 aa  253  4e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  32.68 
 
 
453 aa  252  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  31.46 
 
 
435 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  31.46 
 
 
435 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  34.9 
 
 
445 aa  248  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  35.38 
 
 
444 aa  244  2e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  30.65 
 
 
424 aa  237  3e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  32.83 
 
 
501 aa  235  1e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  33.18 
 
 
430 aa  234  2e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  36.8 
 
 
429 aa  233  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  36.8 
 
 
429 aa  233  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0591  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.14 
 
 
442 aa  233  6e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  35.03 
 
 
435 aa  232  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  37.74 
 
 
431 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  31.5 
 
 
449 aa  231  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  36.43 
 
 
434 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  36.28 
 
 
429 aa  230  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  4.68931e-05 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  32.24 
 
 
452 aa  230  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.12 
 
 
444 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  34.63 
 
 
427 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  35.49 
 
 
436 aa  227  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  35.51 
 
 
429 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  34.57 
 
 
429 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  34 
 
 
426 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  35.27 
 
 
429 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  35.27 
 
 
429 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  35.27 
 
 
429 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  33.78 
 
 
425 aa  222  1e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  34.78 
 
 
429 aa  221  2e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  32.78 
 
 
431 aa  221  2e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.85655e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  34.78 
 
 
429 aa  221  2e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  33.5 
 
 
427 aa  221  2e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  32.14 
 
 
448 aa  221  2e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  32.82 
 
 
427 aa  221  2e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  35.85 
 
 
429 aa  221  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  34.94 
 
 
431 aa  221  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  34 
 
 
436 aa  221  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  35.85 
 
 
429 aa  219  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>