63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2996 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2996  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  241  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1793  hypothetical protein  64.55 
 
 
127 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0653  hypothetical protein  32.76 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1133  S23 ribosomal protein  35.42 
 
 
125 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1809  hypothetical protein  36.84 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0042  hypothetical protein  36.84 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1773  hypothetical protein  36.84 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0046265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0903  hypothetical protein  36.84 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118462  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1554  S23 ribosomal protein  35.78 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0769  hypothetical protein  33.02 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0716  hypothetical protein  33.02 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0352  hypothetical protein  32.38 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.50367  normal  0.137183 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1495  S23 ribosomal protein  39.58 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0596  S23 ribosomal protein  34.23 
 
 
122 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0419728  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2269  S23 ribosomal protein  27.83 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1768  S23 ribosomal protein  35.87 
 
 
127 aa  50.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.392074  normal  0.0791201 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2821  hypothetical protein  41.56 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0984  S23 ribosomal  33.02 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.302642  normal  0.219777 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0809  S23 ribosomal protein  28.18 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2639  S23 ribosomal protein  29.91 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2230  hypothetical protein  31.78 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.8637e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1160  S23 ribosomal protein  34.04 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1396  hypothetical protein  41.33 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4923  S23 ribosomal protein  31.91 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4754  S23 ribosomal protein  32.88 
 
 
117 aa  48.9  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.32042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2842  hypothetical protein  38.96 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.578199  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0702  hypothetical protein  25.71 
 
 
130 aa  48.9  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2263  hypothetical protein  31.82 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00175463  decreased coverage  0.000429969 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0510  S23 ribosomal protein  26.8 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426974  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1652  hypothetical protein  40.26 
 
 
125 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193408  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3192  hypothetical protein  38.96 
 
 
117 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1383  hypothetical protein  35.11 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2542  hypothetical protein  37.66 
 
 
117 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1316  hypothetical protein  37.66 
 
 
117 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0254819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3082  hypothetical protein  33.77 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2018  S23 ribosomal protein  28.97 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.575414  normal  0.264087 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0743  S23 ribosomal protein  34.94 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2958  hypothetical protein  27.78 
 
 
117 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1843  S23 ribosomal protein  30.09 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.561977  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1260  hypothetical protein  33.96 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2947  hypothetical protein  33.96 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4365  S23 ribosomal  28.57 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.981218  normal  0.704063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1266  hypothetical protein  33.96 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0008  hypothetical protein  33.96 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0176  hypothetical protein  33.96 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.713236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2021  hypothetical protein  33.96 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.933908  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2670  hypothetical protein  32 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2528  hypothetical protein  33.96 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3459  S23 ribosomal protein  36.99 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0610  S23 ribosomal protein  29.73 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28865e-18 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1908  S23 ribosomal protein  26.26 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0472505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0405  hypothetical protein  33.96 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.743042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  31.19 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1770  hypothetical protein  31.11 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00388506  normal  0.0836423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4875  S23 ribosomal protein  31.17 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3829  S23 ribosomal protein  35.06 
 
 
123 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0815906  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3674  S23 ribosomal protein  25.71 
 
 
119 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0797  hypothetical protein  30 
 
 
115 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171877 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0667  S23 ribosomal protein  27.83 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1973  S23 ribosomal protein  27.1 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.174055 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1780  hypothetical protein  30.99 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3816  hypothetical protein  31.07 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3761  S23 ribosomal protein  28.93 
 
 
127 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>