More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2983 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
404 aa  801    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  27.15 
 
 
384 aa  131  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  25.69 
 
 
405 aa  126  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 
385 aa  126  9e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 
381 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 
391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
388 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  26.09 
 
 
409 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  26.38 
 
 
386 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  25.2 
 
 
397 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  26.89 
 
 
414 aa  96.7  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  26.88 
 
 
388 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  26.58 
 
 
373 aa  95.9  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  25.07 
 
 
423 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  24.79 
 
 
423 aa  94.7  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  25.35 
 
 
423 aa  94.4  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  26.53 
 
 
409 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  26.43 
 
 
421 aa  92.8  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 
383 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 
414 aa  90.9  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  26.15 
 
 
403 aa  89.7  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.33 
 
 
440 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  26.27 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  26.92 
 
 
409 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  28.01 
 
 
421 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  28.66 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 
439 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  25.43 
 
 
432 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 
403 aa  81.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  24.94 
 
 
432 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  25.99 
 
 
432 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  25.99 
 
 
432 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  26.48 
 
 
409 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  25.63 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 
406 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 
407 aa  76.3  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  24.01 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  34.3 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1851  major facilitator transporter  25.43 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  29.95 
 
 
487 aa  73.2  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  22.4 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1767  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18145 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 
414 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  21.5 
 
 
474 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 
406 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 
408 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  25.58 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  28.57 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  26.87 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  28.57 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  26.87 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  26.87 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  28.57 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  23.9 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  22.77 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  23.37 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  25.95 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.06 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1525  major facilitator transporter  31.14 
 
 
519 aa  67.4  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  23.44 
 
 
416 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  26.33 
 
 
413 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  24.3 
 
 
416 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 
420 aa  67.4  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  22.51 
 
 
420 aa  67  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4090  major facilitator transporter  23.82 
 
 
417 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116905  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4739  major facilitator transporter  23.82 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.14 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 
430 aa  66.2  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  22.75 
 
 
387 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  22.52 
 
 
405 aa  65.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5210  major facilitator transporter  24.35 
 
 
416 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.925158  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3427  major facilitator transporter  23.82 
 
 
462 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  29.3 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3222  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 
408 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40917  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.56 
 
 
388 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  24.66 
 
 
409 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.56 
 
 
388 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  22.06 
 
 
422 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 
450 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  23.98 
 
 
412 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  27.04 
 
 
403 aa  64.3  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
407 aa  64.7  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 
396 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.81 
 
 
590 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3372  major facilitator transporter  24.09 
 
 
416 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002192  putative MFS transporter  24.65 
 
 
385 aa  63.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0137434  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  23.16 
 
 
398 aa  63.9  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  25.6 
 
 
387 aa  63.9  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  23.18 
 
 
411 aa  63.9  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  23.87 
 
 
401 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>