More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2967 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  71.56 
 
 
665 aa  903    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
762 aa  1514    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  65.83 
 
 
775 aa  989    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  68.87 
 
 
773 aa  1018    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  66.27 
 
 
771 aa  963    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  71.56 
 
 
665 aa  903    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4813  sodium/hydrogen exchanger  52.11 
 
 
666 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  34.86 
 
 
650 aa  385  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  36.48 
 
 
671 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  38.27 
 
 
662 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  35.81 
 
 
673 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  35.95 
 
 
674 aa  375  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  34.59 
 
 
667 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  37.22 
 
 
652 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  39.29 
 
 
567 aa  348  2e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  39.29 
 
 
567 aa  348  3e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.75 
 
 
567 aa  345  2e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  33.08 
 
 
658 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  33.68 
 
 
674 aa  334  5e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.59 
 
 
697 aa  330  6e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  33.28 
 
 
672 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  33.39 
 
 
636 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  32.86 
 
 
671 aa  325  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  33.74 
 
 
664 aa  325  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  34.04 
 
 
674 aa  324  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  32.54 
 
 
684 aa  322  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.16 
 
 
663 aa  321  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  33.64 
 
 
659 aa  320  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  34.1 
 
 
659 aa  320  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  33.39 
 
 
668 aa  320  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  32.73 
 
 
666 aa  320  6e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  33.28 
 
 
688 aa  319  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  34.18 
 
 
666 aa  318  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  32.86 
 
 
741 aa  317  5e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  33.8 
 
 
678 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  36.34 
 
 
693 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  33.96 
 
 
668 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  33.96 
 
 
668 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  33.87 
 
 
665 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  33.96 
 
 
668 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  34.1 
 
 
659 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  34.72 
 
 
659 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  33.08 
 
 
667 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  32.34 
 
 
682 aa  310  5e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  33.64 
 
 
666 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  32.09 
 
 
666 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  33.07 
 
 
666 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  33.7 
 
 
667 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  34.27 
 
 
670 aa  306  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  33.07 
 
 
663 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.33 
 
 
669 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  34.11 
 
 
670 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  33.18 
 
 
660 aa  305  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  32.67 
 
 
663 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.92 
 
 
669 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  32.92 
 
 
669 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.92 
 
 
669 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.92 
 
 
669 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.92 
 
 
669 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  33.97 
 
 
660 aa  302  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  32.08 
 
 
664 aa  301  3e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119547  potassium:hydrogen antiporter, putative  43.56 
 
 
671 aa  300  8e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.2676  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.7 
 
 
680 aa  298  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  30.99 
 
 
665 aa  298  3e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  33.28 
 
 
672 aa  298  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  32.02 
 
 
656 aa  297  5e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  32.34 
 
 
676 aa  297  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  32.78 
 
 
661 aa  293  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  33.33 
 
 
658 aa  289  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  33.33 
 
 
664 aa  288  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  35.56 
 
 
573 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  32.77 
 
 
564 aa  287  4e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  33.54 
 
 
668 aa  287  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3064  Sodium/hydrogen exchanger  34.64 
 
 
565 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  32.14 
 
 
661 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  32.14 
 
 
661 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  30.3 
 
 
670 aa  283  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0567  hypothetical protein  32.14 
 
 
564 aa  282  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  30.08 
 
 
662 aa  281  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  31.73 
 
 
652 aa  281  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  33.57 
 
 
583 aa  280  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  32.63 
 
 
656 aa  279  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  32.29 
 
 
648 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  32.45 
 
 
648 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  32.13 
 
 
648 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  35.21 
 
 
562 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  33.63 
 
 
566 aa  275  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  30.47 
 
 
650 aa  274  6e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  34.03 
 
 
585 aa  273  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  32.88 
 
 
661 aa  272  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  32.29 
 
 
648 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  31.03 
 
 
648 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  33.75 
 
 
665 aa  271  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  32.08 
 
 
655 aa  270  8e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  34.77 
 
 
555 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  35.66 
 
 
577 aa  268  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  33.69 
 
 
567 aa  268  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  31.71 
 
 
648 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  32.24 
 
 
648 aa  267  7e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  32.65 
 
 
661 aa  266  8.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>