More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2954 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2954  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
170 aa  344  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.916978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2525  pentapeptide repeat protein  71.26 
 
 
172 aa  249  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3581  pentapeptide repeat protein  70.06 
 
 
172 aa  246  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2678  pentapeptide repeat-containing protein  58.79 
 
 
168 aa  204  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2129  pentapeptide repeat-containing protein  48.81 
 
 
165 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.283688  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1361  hypothetical protein  50.35 
 
 
167 aa  140  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0229  pentapeptide repeat protein  49.33 
 
 
162 aa  137  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.584528 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0362  pentapeptide repeat-containing protein  42.77 
 
 
163 aa  135  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.571178  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4307  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 
182 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.154552  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16121  hypothetical protein  45.86 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.385195 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1536  hypothetical protein  40 
 
 
182 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.916018  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1609  pentapeptide repeat protein  40.88 
 
 
174 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0575  pentapeptide repeat protein  45.24 
 
 
168 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0592  pentapeptide repeat protein  45.24 
 
 
168 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0856  hypothetical protein  40.29 
 
 
181 aa  101  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11531  hypothetical protein  39.31 
 
 
183 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0502913  normal  0.0854137 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4862  pentapeptide repeat-containing protein  35.37 
 
 
164 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0712  hpothetical protein  39.24 
 
 
184 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2584  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 
171 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.14087  normal  0.252585 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1115  pentapeptide repeat protein  41.35 
 
 
168 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15481  hypothetical protein  39.24 
 
 
184 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2759  pentapeptide repeat-containing protein  34.76 
 
 
164 aa  98.2  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1285  hypothetical protein  43.8 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.967033  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11461  hypothetical protein  42.42 
 
 
172 aa  95.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1185  hypothetical protein  39.61 
 
 
165 aa  95.1  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1053  hypothetical protein  36.63 
 
 
172 aa  95.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11471  hypothetical protein  42.42 
 
 
172 aa  95.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07611  pentapeptide repeat-containing protein  37.82 
 
 
158 aa  94.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  hitchhiker  0.00156438 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1840  hypothetical protein  35.54 
 
 
168 aa  94.7  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0702496 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19861  hypothetical protein  35.84 
 
 
179 aa  94  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.028924 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11321  hypothetical protein  37.21 
 
 
172 aa  93.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1219  hypothetical protein  39.84 
 
 
169 aa  92.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1263  hypothetical protein  34.55 
 
 
169 aa  91.7  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0734  pentapeptide repeat-containing protein  39.19 
 
 
144 aa  91.3  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.649319 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_10544  predicted protein  36.07 
 
 
123 aa  90.9  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00165486  hitchhiker  0.0000000637684 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16951  hypothetical protein  35.48 
 
 
198 aa  89  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.62237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3657  pentapeptide repeat-containing protein  35.19 
 
 
194 aa  88.2  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3470  pentapeptide repeat-containing protein  37.12 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09851  hypothetical protein  30.81 
 
 
169 aa  84.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.176778 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07051  pentapeptide repeat-containing protein  33.99 
 
 
157 aa  84.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.186987  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0649  pentapeptide repeat-containing protein  37.12 
 
 
157 aa  84.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0313  hypothetical protein  35.12 
 
 
170 aa  84  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.967815  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3923  pentapeptide repeat protein  30.06 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0131528  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07151  pentapeptide repeat-containing protein  37.88 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.102033  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06761  pentapeptide repeat-containing protein  35.61 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.168299  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3874  pentapeptide repeat protein  31.54 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08061  hypothetical protein  31.93 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1548  pentapeptide repeat protein  31.58 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0089  pentapeptide repeat-containing protein  32.14 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08391  hypothetical protein  29.52 
 
 
170 aa  73.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08371  hypothetical protein  29.52 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_8317  predicted protein  36.36 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0135698  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11313  predicted protein  35.11 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.129582  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0785  hypothetical protein  28.92 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.859693  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03791  pentapeptide repeat-containing protein  38.39 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.48693 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0183  pentapeptide repeat-containing protein  33.61 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08151  hypothetical protein  33.61 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  42.2 
 
 
389 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1448  pentapeptide repeat-containing protein  32.93 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07131  pentapeptide repeat-containing protein  31.82 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10537  predicted protein  39.17 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0914569  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15511  pentapeptide repeat-containing protein  32.85 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.121299  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15361  pentapeptide repeat-containing protein  32.85 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32219  predicted protein  27.91 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0417317  normal  0.112837 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55176  predicted protein  31.78 
 
 
235 aa  63.9  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.21249  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14041  pentapeptide repeat-containing protein  34.15 
 
 
184 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.276957  normal  0.0592863 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0921  pentapeptide repeat-containing protein  33.57 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17771  pentapeptide repeat-containing protein  28.39 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.114465  normal  0.674203 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15111  pentapeptide repeat-containing protein  31.47 
 
 
192 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.783575  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  37.25 
 
 
1033 aa  59.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11235  predicted protein  31.62 
 
 
109 aa  59.3  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3157  pentapeptide repeat protein  34.01 
 
 
145 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400577  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2939  pentapeptide repeat protein  34.01 
 
 
145 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  39.8 
 
 
145 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0445  hypothetical protein  42.35 
 
 
239 aa  57.8  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  32.11 
 
 
533 aa  57  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  34.95 
 
 
449 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1882  hypothetical protein  44.05 
 
 
234 aa  55.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  36.27 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  31.85 
 
 
320 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  35.24 
 
 
333 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  35.16 
 
 
493 aa  55.1  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  38.05 
 
 
576 aa  54.3  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  33.03 
 
 
524 aa  54.3  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  30.43 
 
 
174 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0537  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
959 aa  54.3  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.884465  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  36.94 
 
 
340 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  39.8 
 
 
521 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  35.85 
 
 
493 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  33.58 
 
 
147 aa  53.9  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  35.92 
 
 
441 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  40.22 
 
 
151 aa  53.9  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
446 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  36.51 
 
 
266 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  36.96 
 
 
215 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  35.79 
 
 
260 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  30.6 
 
 
734 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
312 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  35.87 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  32.19 
 
 
213 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>