More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2937 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2937  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
195 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  45.13 
 
 
184 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  35.64 
 
 
184 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  43.29 
 
 
517 aa  94  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 
263 aa  92.4  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  37.68 
 
 
309 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  43.95 
 
 
521 aa  89.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  35.86 
 
 
189 aa  89  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  41.22 
 
 
267 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  43.36 
 
 
187 aa  89  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  42.19 
 
 
449 aa  87.8  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  40.35 
 
 
294 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  40.49 
 
 
180 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  44.08 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  37.43 
 
 
294 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  42.58 
 
 
234 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  42.58 
 
 
234 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  41.21 
 
 
182 aa  86.3  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  37.22 
 
 
332 aa  85.1  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  39.18 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  41.14 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  36.61 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  42.07 
 
 
441 aa  83.2  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  43.75 
 
 
1033 aa  82.4  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 
824 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  38.3 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  42.11 
 
 
576 aa  82  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  40.99 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  35.48 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  34.38 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  34.55 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  46.51 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4194  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  39.76 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  36.13 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  47.73 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  49.61 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  41.61 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  36.93 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  36.99 
 
 
830 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  42.21 
 
 
333 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  41.48 
 
 
567 aa  78.6  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  39.35 
 
 
336 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  39.35 
 
 
336 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  39.51 
 
 
483 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  40.12 
 
 
234 aa  77.8  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  39.71 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  41.52 
 
 
213 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  40.24 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  34.2 
 
 
493 aa  77.4  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  40.57 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 
489 aa  76.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  48.03 
 
 
418 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  36.3 
 
 
830 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  40.57 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  38.85 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  42.03 
 
 
416 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  37.72 
 
 
903 aa  76.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  38.04 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  38.04 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  37.13 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  33.81 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  40.13 
 
 
432 aa  75.1  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  41.28 
 
 
291 aa  74.7  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  41.56 
 
 
311 aa  75.1  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  41.28 
 
 
291 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  39.86 
 
 
745 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  40.67 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  38.1 
 
 
1191 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  33.71 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  39.04 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4134  pentapeptide repeat protein  42.98 
 
 
137 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159468  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  40.54 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  35.87 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  39.68 
 
 
537 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  38 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  34.5 
 
 
381 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  35.9 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  37.36 
 
 
260 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
222 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  37.27 
 
 
259 aa  72  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  42.47 
 
 
264 aa  72  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  37.18 
 
 
143 aa  72  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  36.05 
 
 
219 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  37.58 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  36.53 
 
 
267 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  43.84 
 
 
493 aa  71.6  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  39.07 
 
 
448 aa  71.6  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  42.57 
 
 
973 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  44.2 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0477  pentapeptide repeat protein  31.28 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  33.15 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  34.81 
 
 
862 aa  70.1  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  34.84 
 
 
446 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  41.22 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  35.11 
 
 
949 aa  69.7  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>